More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2377 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2377  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000483861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  84.3 
 
 		 121 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  83.47 
 
 		 121 aa  211  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0219  30S ribosomal protein S13  73.17 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0440156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1459  30S ribosomal protein S13  72.73 
 
 		 121 aa  183  8e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000394716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  71.9 
 
 		 121 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  71.9 
 
 		 121 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  71.9 
 
 		 121 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 121 aa  177  4.999999999999999e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  70.25 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 121 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 121 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 121 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0618  30S ribosomal protein S13  69.11 
 
 		 123 aa  174  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  70.25 
 
 		 121 aa  174  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 121 aa  173  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  166  9e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0314  30S ribosomal protein S13  68.47 
 
 		 115 aa  166  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  9.88789e-29 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  61.72 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  158  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  156  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  60.66 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  154  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 124 aa  153  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 125 aa  153  8e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  153  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 123 aa  153  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  57.85 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 126 aa  151  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 125 aa  151  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 125 aa  149  8.999999999999999e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  59.02 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0447  30S ribosomal protein S13  61.21 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202005  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0511  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0430719  normal  0.0101578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3686  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3721  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0277516  normal  0.14692 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3613  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000260189  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3784  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3614  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105943  normal  0.48549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03149  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0567144  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.62 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053345  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3593  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00190616  normal  0.0522368 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4620  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000695624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3684  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000603669  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3492  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957981  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0081  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000227347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3781  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000117376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0415  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000337677  unclonable  0.000000013853 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03100  hypothetical protein  58.62 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0375392  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0506  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00117339  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 124 aa  147  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  58.2 
 
 		 124 aa  146  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>