238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2347 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2347  amidase  100 
 
 
164 aa  344  4e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  50.31 
 
 
170 aa  177  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  50 
 
 
169 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  50 
 
 
169 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  49.69 
 
 
170 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  49.4 
 
 
169 aa  175  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  49.38 
 
 
170 aa  173  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  48.77 
 
 
170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  48.48 
 
 
166 aa  167  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  48.68 
 
 
153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  48.45 
 
 
164 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  44.03 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
188 aa  95.5  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 
177 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  36.18 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  34.87 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 
177 aa  87.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  28.68 
 
 
186 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  34 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  29.3 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  29.3 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 
175 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  29.3 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  29.3 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  29.3 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  29.3 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 
185 aa  79  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  29.3 
 
 
183 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  30.46 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  28.92 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  28.66 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.46 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  29.14 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2589  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  27.38 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0515  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0487  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  27.16 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  28.48 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  28.48 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  28.48 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  28.48 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  29.63 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  27.74 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  31.3 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  27.16 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
185 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 
180 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 
180 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  26.83 
 
 
180 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 
181 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  28.37 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  25.35 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2448  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 
191 aa  58.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00167941  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
201 aa  57.8  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  25.95 
 
 
176 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  28.1 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  28.1 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  26.14 
 
 
190 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  28.1 
 
 
184 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  25.57 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  27.78 
 
 
196 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  24.64 
 
 
199 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  28.1 
 
 
184 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1761  isochorismatase family protein  25.47 
 
 
186 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  28.1 
 
 
184 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  22.7 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
201 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1504  isochorismatase family protein  24.84 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1476  isochorismatase  24.84 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.731816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1620  isochorismatase family protein  24.84 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 
181 aa  54.3  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  24.39 
 
 
216 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  27.45 
 
 
185 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3689  isochorismatase family protein  24.84 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 
226 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  24.29 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 
226 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  24.46 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>