More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2284 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  88.65 
 
 		 141 aa  257  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  86.52 
 
 		 141 aa  251  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  81.29 
 
 		 140 aa  229  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  229  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  75.18 
 
 		 141 aa  227  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 141 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  79.86 
 
 		 140 aa  226  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  79.86 
 
 		 140 aa  226  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  73.76 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  73.76 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  82.27 
 
 		 141 aa  215  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000373457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  71.94 
 
 		 141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  73.38 
 
 		 141 aa  213  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 142 aa  212  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  72.66 
 
 		 141 aa  211  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 142 aa  209  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  207  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  75.76 
 
 		 143 aa  206  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  73.05 
 
 		 141 aa  204  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  65.96 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0356  50S ribosomal protein L11  80.14 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000696128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  73.38 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  203  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 141 aa  204  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  203  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 140 aa  201  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  70.5 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3693  ribosomal protein L11  73.76 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000590781  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 141 aa  194  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  193  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 140 aa  192  9e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  66.42 
 
 		 143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  65 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  65.71 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  61.15 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 145 aa  186  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 140 aa  186  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  64.23 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  68.99 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  64.96 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 140 aa  184  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  71.94 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  67.88 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  64.75 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>