More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2283 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  82.97 
 
 		 229 aa  367  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  82.97 
 
 		 229 aa  358  3e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  68.56 
 
 		 231 aa  320  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 230 aa  318  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 230 aa  318  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  64 
 
 		 230 aa  302  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  63.56 
 
 		 233 aa  300  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  60.35 
 
 		 253 aa  294  7e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  64.32 
 
 		 233 aa  293  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  65.79 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  59.39 
 
 		 231 aa  289  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  61.88 
 
 		 235 aa  289  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  61.43 
 
 		 230 aa  287  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  64.91 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1418  50S ribosomal protein L1P  58.15 
 
 		 230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000214693  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  62.88 
 
 		 232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  65.5 
 
 		 230 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  65.07 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 230 aa  279  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 230 aa  279  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 230 aa  279  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 230 aa  279  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 230 aa  279  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 230 aa  279  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 230 aa  279  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  64.63 
 
 		 230 aa  279  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  61.43 
 
 		 238 aa  278  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  60.35 
 
 		 238 aa  278  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  59.28 
 
 		 233 aa  278  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  61.06 
 
 		 238 aa  278  7e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  65.07 
 
 		 230 aa  278  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 236 aa  277  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  60.54 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  59.47 
 
 		 236 aa  275  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  59.55 
 
 		 233 aa  274  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 235 aa  272  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 		 233 aa  271  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 		 232 aa  271  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  60.35 
 
 		 235 aa  271  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  59.53 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 226 aa  271  7e-72  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  59.53 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 		 234 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  59.07 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  58.95 
 
 		 231 aa  270  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  60.89 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 234 aa  268  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  64 
 
 		 237 aa  268  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 233 aa  266  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  63.11 
 
 		 235 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  57.78 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  62.83 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 227 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  57.85 
 
 		 225 aa  265  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 229 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 231 aa  264  8e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  56.39 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  58.33 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  57.02 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  56.77 
 
 		 237 aa  262  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  57.59 
 
 		 237 aa  262  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 235 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 236 aa  261  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  58.77 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 		 235 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 		 235 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 		 235 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  63.11 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  60.35 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  57.35 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  55.61 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  62.33 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 234 aa  260  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  56.5 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  59.26 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0270  50S ribosomal protein L1  59.64 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000998877  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 232 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  57.78 
 
 		 235 aa  258  6e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 232 aa  258  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 229 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  59.64 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  57.02 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  56.44 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>