59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2269 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2269  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  258  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0652  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  37.7 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0904  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1882  prophage LambdaSa2, repressor protein, putative  34.58 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  27.97 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4801  helix-turn-helix domain protein  43.86 
 
 		 261 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1983  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 224 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.675652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3075  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 281 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1687  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00137686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  33.72 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  35.37 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  35.37 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  35.37 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  35.37 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.71 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  35.37 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  35.37 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  35.37 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1344  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.043914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0157  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 231 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1536  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  29.17 
 
 		 200 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 321 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 114 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2782  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.78 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.821719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 78 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>