More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2238 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  100 
 
 
359 aa  734  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  55.8 
 
 
366 aa  394  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  54.14 
 
 
369 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  49.87 
 
 
374 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  49.59 
 
 
373 aa  356  3e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  49.46 
 
 
375 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  49.46 
 
 
375 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  49.46 
 
 
375 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  49.46 
 
 
375 aa  348  6e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.04808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  49.46 
 
 
375 aa  348  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  49.46 
 
 
375 aa  348  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  49.46 
 
 
375 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  48.52 
 
 
375 aa  347  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  49.46 
 
 
375 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  48.92 
 
 
375 aa  346  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  45.92 
 
 
372 aa  337  1e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  46.92 
 
 
374 aa  333  3e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  47.17 
 
 
371 aa  331  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  48.52 
 
 
374 aa  331  2e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  46.47 
 
 
374 aa  329  5e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  47.03 
 
 
370 aa  329  5e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  47.03 
 
 
370 aa  329  5e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  45.82 
 
 
373 aa  328  7e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  40.77 
 
 
361 aa  279  6e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  40.77 
 
 
361 aa  279  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.65 
 
 
371 aa  274  1e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.88 
 
 
360 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  42.7 
 
 
369 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.36 
 
 
386 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  39.04 
 
 
375 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.48 
 
 
376 aa  245  7e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.71 
 
 
365 aa  232  8e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  36.19 
 
 
371 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.17 
 
 
372 aa  221  2e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  36.86 
 
 
362 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  37.64 
 
 
371 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  33.42 
 
 
392 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.81 
 
 
359 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  33.61 
 
 
364 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  33.78 
 
 
398 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  31.15 
 
 
365 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  35.59 
 
 
370 aa  199  8e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.69508e-07  hitchhiker  1.45417e-07 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.06 
 
 
363 aa  198  1e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  36.57 
 
 
384 aa  196  4e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  32.08 
 
 
365 aa  195  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  38.4 
 
 
376 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  35.68 
 
 
390 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  32.7 
 
 
364 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  33.15 
 
 
370 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.7 
 
 
364 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  32.72 
 
 
377 aa  192  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  34.64 
 
 
385 aa  190  3e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.5 
 
 
362 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.15018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  34.95 
 
 
368 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.14 
 
 
382 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  38.2 
 
 
380 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  38.2 
 
 
380 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.44 
 
 
360 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  31.36 
 
 
371 aa  185  1e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  30.45 
 
 
387 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  34.38 
 
 
386 aa  183  5e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  30.41 
 
 
390 aa  182  9e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.9 
 
 
365 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.23 
 
 
374 aa  179  5e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.61 
 
 
370 aa  179  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  33.14 
 
 
365 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.47 
 
 
377 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  32.09 
 
 
394 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0596  DNA replication and repair protein RecF  33.05 
 
 
351 aa  176  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  31.23 
 
 
369 aa  175  1e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  31.61 
 
 
365 aa  175  1e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  35.8 
 
 
352 aa  174  2e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  31.48 
 
 
371 aa  174  2e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  29.12 
 
 
370 aa  174  2e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  34.94 
 
 
348 aa  174  2e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  34.94 
 
 
348 aa  174  3e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  31.35 
 
 
365 aa  173  3e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  29.95 
 
 
414 aa  173  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  34.39 
 
 
387 aa  173  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.49 
 
 
363 aa  172  6e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.75 
 
 
369 aa  172  6e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  29.06 
 
 
401 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  37.13 
 
 
377 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  29.62 
 
 
390 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  30.93 
 
 
377 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.08 
 
 
363 aa  170  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  32.31 
 
 
368 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.01 
 
 
378 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.78 
 
 
420 aa  169  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.1529e-05  hitchhiker  4.44236e-07 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.35 
 
 
397 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  29.21 
 
 
377 aa  169  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  30.25 
 
 
360 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  32.15 
 
 
366 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  29.2 
 
 
402 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15476e-13 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  28.61 
 
 
404 aa  167  3e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.88 
 
 
370 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  30.5 
 
 
359 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.52 
 
 
372 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.42 
 
 
397 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  30 
 
 
376 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  1.75389e-08 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>