106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2205 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  100 
 
 		 492 aa  1006    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  46.95 
 
 		 483 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  46.3 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  49.24 
 
 		 484 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  47.2 
 
 		 598 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  55.49 
 
 		 699 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  58.82 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  53.13 
 
 		 727 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  46.5 
 
 		 803 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  53.58 
 
 		 729 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  53.58 
 
 		 729 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  53.27 
 
 		 565 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  45.32 
 
 		 471 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  45.27 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  37.95 
 
 		 1113 aa  183  6e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  27.94 
 
 		 1362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  29.88 
 
 		 360 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  29.88 
 
 		 360 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  29.88 
 
 		 360 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  29.57 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  30.49 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  30.49 
 
 		 360 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  30.12 
 
 		 360 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  29.88 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.51 
 
 		 648 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  30.12 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  28.45 
 
 		 848 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  29.31 
 
 		 846 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  29.33 
 
 		 846 aa  120  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  28.1 
 
 		 846 aa  119  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  27.67 
 
 		 543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 1578 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  30.5 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  27.95 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  31.02 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  31.1 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  31.41 
 
 		 551 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 		 551 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  28.45 
 
 		 680 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  28.53 
 
 		 341 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  26.33 
 
 		 376 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  27.97 
 
 		 613 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  36.8 
 
 		 189 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  24.13 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  26.85 
 
 		 467 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  23.5 
 
 		 334 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  39.13 
 
 		 855 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  39.44 
 
 		 848 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  48.89 
 
 		 848 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  44.44 
 
 		 1242 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  43.48 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  24.12 
 
 		 782 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.19 
 
 		 669 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  30.32 
 
 		 674 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  32.91 
 
 		 816 aa  51.2  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2348  hypothetical protein  25.82 
 
 		 308 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  41.86 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  31.78 
 
 		 1577 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  23.65 
 
 		 782 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  40.43 
 
 		 1331 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  33.59 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  30.53 
 
 		 787 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  26.98 
 
 		 655 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2016  hypothetical protein  22.87 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630199  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  30.83 
 
 		 458 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  25 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  30.6 
 
 		 458 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  24.55 
 
 		 536 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  35.16 
 
 		 847 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  22.67 
 
 		 582 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  27.1 
 
 		 674 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  41.86 
 
 		 1057 aa  47.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  34.85 
 
 		 393 aa  47.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  36.17 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  37.21 
 
 		 772 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  38.64 
 
 		 523 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  36.21 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 674 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  26.32 
 
 		 1115 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  31.71 
 
 		 660 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  25.94 
 
 		 2170 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  42.22 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  26.97 
 
 		 674 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  32.54 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  36.17 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  31.71 
 
 		 749 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  32.26 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  41.86 
 
 		 1054 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  34.09 
 
 		 900 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  32.97 
 
 		 1154 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  35.42 
 
 		 1887 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  33.33 
 
 		 455 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  33.33 
 
 		 455 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.06 
 
 		 455 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  32.26 
 
 		 455 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  26 
 
 		 674 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  26 
 
 		 674 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  50 
 
 		 985 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>