More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2186 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
379 aa  733    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  55.59 
 
 
375 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  47.35 
 
 
386 aa  310  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  41.49 
 
 
389 aa  289  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  40.21 
 
 
375 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  40.21 
 
 
375 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  39.41 
 
 
375 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  39.95 
 
 
375 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  39.95 
 
 
375 aa  262  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  39.95 
 
 
375 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  39.95 
 
 
375 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  39.41 
 
 
375 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  38.96 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  38.1 
 
 
387 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  38.1 
 
 
387 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  38.1 
 
 
387 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  38.1 
 
 
387 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  38.1 
 
 
387 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  37.83 
 
 
387 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  37.83 
 
 
387 aa  255  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  39.95 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  39.95 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  37.3 
 
 
387 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  39.68 
 
 
375 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  37.83 
 
 
387 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  37.83 
 
 
387 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  37.43 
 
 
389 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  41.94 
 
 
352 aa  246  3e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  35.79 
 
 
396 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0547  Kef-type K+ transport systems, membrane component  37.14 
 
 
318 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  36.11 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 
382 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  34.93 
 
 
400 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  35.56 
 
 
445 aa  185  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  35.63 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  34.54 
 
 
399 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 
412 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.71 
 
 
427 aa  169  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 
402 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  34.71 
 
 
424 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  34.47 
 
 
424 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 
397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 
399 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  29.69 
 
 
385 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.33 
 
 
418 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  32.94 
 
 
392 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 
404 aa  150  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  30.23 
 
 
423 aa  149  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 
392 aa  149  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 
395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 
398 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 
404 aa  146  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 
412 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 
491 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  30.48 
 
 
650 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.4 
 
 
474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 
414 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 
469 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  28.32 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  29.52 
 
 
479 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  29.38 
 
 
479 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 
467 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 
467 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 
415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 
388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  27.44 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 
413 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 
586 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 
388 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 
388 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  28.24 
 
 
701 aa  126  6e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 
388 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 
473 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 
413 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 
586 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 
586 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  28.4 
 
 
421 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  28.16 
 
 
586 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 
436 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  27.39 
 
 
582 aa  123  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  26.74 
 
 
741 aa  122  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 
584 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  30.08 
 
 
584 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  32.37 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 
748 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.8 
 
 
697 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
485 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  25.99 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 
586 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.68 
 
 
587 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.15 
 
 
587 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 
587 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 
671 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  27.63 
 
 
585 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.75 
 
 
585 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>