More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2065 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  70.54 
 
 		 251 aa  357  9e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  68.49 
 
 		 247 aa  348  3e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  52.07 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  52.07 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  48.97 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  50.45 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  49.18 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  49.18 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  48.54 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.21 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  49.79 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  49.79 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  49.79 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  49.79 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  49.79 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  49.79 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  49.79 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  48.35 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.92 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  50.21 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  49.59 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.08 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.86 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.35 
 
 		 246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.86 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  41.98 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.11 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.65 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  41.49 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  41.49 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.5 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  42.08 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.15 
 
 		 315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.98 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  41.15 
 
 		 277 aa  188  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.98 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  41.74 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.53 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.39 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.39 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.67 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  41.67 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  41.63 
 
 		 270 aa  181  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.97 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  41.63 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  40.98 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.42 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  41 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  40 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.59 
 
 		 327 aa  178  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  39.84 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  39.84 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  40.51 
 
 		 248 aa  174  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  38.68 
 
 		 323 aa  174  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  40.74 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.27 
 
 		 387 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  39.15 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.34 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  38.17 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  37.76 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.59 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  38.89 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.93 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.08 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.51 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.93 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  39.43 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  39.43 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  39.43 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  39.43 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  39.43 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  37.04 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  39.43 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  39.43 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  39.43 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0060  RNA methyltransferase  38.4 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.024169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.59 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.71 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1952  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.96 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  39.27 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0690  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.08 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3644  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.08 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  36.76 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3790  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.08 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  38.21 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0065  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.6 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000946676  normal  0.572135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0363  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.14 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.06 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.21 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  37.65 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.21 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  37.65 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  38.21 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  38.21 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  34.16 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.9 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  36.33 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf131  SpoU class tRNA/rRNA methyltransferase  37.02 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>