More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2050 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  100 
 
 		 143 aa  290  4e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  44.59 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  43.54 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.54 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.72 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.1 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.24 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.47 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.29 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.1 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 166 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 166 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  31.72 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  32.24 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  32.24 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  32.24 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  32.24 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  32.24 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  32.24 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  32.24 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  32.24 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  31.45 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  35.92 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.24 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.71 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  32.21 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  34.67 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.71 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.71 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.64 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.29 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  31.94 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.77 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.29 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.29 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.29 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.29 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  29.29 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  30.94 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.32 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  33.99 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  33.99 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  27.59 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.25 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  34.97 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  31.03 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.43 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  29.37 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30 
 
 		 290 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30.07 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  30.67 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.67 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  29.37 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.28 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  29.29 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  30.07 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.86 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  29.41 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  35.95 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  32.05 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.61 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.54 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.41 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.22 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.34 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.29 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  28.76 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.47 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  28.67 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  28.03 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>