More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1933 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.84 
 
 
472 aa  657    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.31 
 
 
470 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.28 
 
 
470 aa  731    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.92 
 
 
470 aa  738    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.44 
 
 
468 aa  754    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  87.87 
 
 
468 aa  816    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.49 
 
 
469 aa  755    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.49 
 
 
469 aa  755    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.79 
 
 
476 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.49 
 
 
469 aa  755    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.01 
 
 
475 aa  747    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.19 
 
 
473 aa  753    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.49 
 
 
469 aa  755    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  68.95 
 
 
465 aa  648    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.66 
 
 
462 aa  662    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.01 
 
 
464 aa  750    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.73 
 
 
465 aa  664    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  68.59 
 
 
464 aa  647    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.56 
 
 
473 aa  748    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.03 
 
 
465 aa  645    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
465 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.7 
 
 
469 aa  758    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.19 
 
 
475 aa  649    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.44 
 
 
468 aa  754    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.23 
 
 
468 aa  754    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.92 
 
 
470 aa  738    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
469 aa  947    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.73 
 
 
504 aa  725    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.99 
 
 
480 aa  742    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.73 
 
 
466 aa  718    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  87.21 
 
 
468 aa  832    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
470 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.23 
 
 
468 aa  753    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.49 
 
 
469 aa  754    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 
471 aa  634    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  73.04 
 
 
467 aa  685    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
470 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  66.81 
 
 
487 aa  632  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.52 
 
 
471 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
493 aa  628  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
484 aa  631  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 
465 aa  630  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
471 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  69.13 
 
 
493 aa  624  1e-178  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
484 aa  626  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
468 aa  625  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
468 aa  624  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  67.02 
 
 
471 aa  625  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  66.81 
 
 
479 aa  625  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.82 
 
 
474 aa  621  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
470 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
465 aa  622  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.27 
 
 
467 aa  623  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
465 aa  622  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
470 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
465 aa  621  1e-177  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
462 aa  619  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
465 aa  620  1e-176  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  66.02 
 
 
465 aa  619  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  65.95 
 
 
470 aa  619  1e-176  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
462 aa  619  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 
481 aa  621  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
478 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
462 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
465 aa  620  1e-176  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  66.74 
 
 
470 aa  617  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  65.67 
 
 
472 aa  616  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
475 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
462 aa  616  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
475 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
462 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
475 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
472 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.47 
 
 
481 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.17 
 
 
486 aa  611  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.6 
 
 
482 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.09 
 
 
476 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  65.73 
 
 
485 aa  612  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.47 
 
 
474 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.17 
 
 
485 aa  611  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  65.88 
 
 
477 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
484 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  65.46 
 
 
476 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
464 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0912  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.92 
 
 
504 aa  608  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
462 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.82 
 
 
474 aa  610  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.96 
 
 
513 aa  611  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  68.24 
 
 
503 aa  608  1e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  64.93 
 
 
501 aa  609  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 
503 aa  608  1e-173  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.53 
 
 
469 aa  608  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.09 
 
 
465 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.26 
 
 
486 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
470 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.11 
 
 
475 aa  606  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2744  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.67 
 
 
465 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.885602  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.75 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>