More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1808 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  100 
 
 		 104 aa  214  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  80.77 
 
 		 104 aa  176  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  75 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  56 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  54 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  54.37 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  56.99 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  55.56 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.52 
 
 		 104 aa  113  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  51.55 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  51.55 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  52.08 
 
 		 104 aa  110  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  52.63 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  53.19 
 
 		 116 aa  107  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  52.63 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  52.63 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  49.02 
 
 		 109 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  51.58 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  52.81 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  46 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  52.13 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  50.51 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  48.51 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  52.38 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  45.83 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  47.12 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  50.53 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  47.52 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  49.49 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  51.52 
 
 		 108 aa  103  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  51.52 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  51.06 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  48.04 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  46 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  48.98 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  49.47 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  46 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  48.48 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  46 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  48.96 
 
 		 259 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  48.48 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  46 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  47.87 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  46 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  48.48 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  49.5 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  46 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  54.35 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  46.88 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  48.96 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  47 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  48.91 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  48.96 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  51.06 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  45.19 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  49.47 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  47.96 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  45.74 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  47.47 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  48.96 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  53.93 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  45.83 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  47.92 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  44.44 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  48.96 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  47.12 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  48.96 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  53.19 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  51.52 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  42.16 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  46.81 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  48.42 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  45.19 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  48.42 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  48.42 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  50.49 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  50.56 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  50 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  50 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  44.44 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  47.37 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  48.98 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  46.81 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  53.49 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  44.79 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  44.23 
 
 		 259 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  44.79 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  44.79 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  44.79 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  44.79 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  44.79 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  44.79 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  44.79 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  44.79 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  44.79 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>