More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1802 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 		 306 aa  621  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  54.79 
 
 		 303 aa  352  2.9999999999999997e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  48.81 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  47.33 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  47.67 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  47 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  47.67 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  47.35 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  47.02 
 
 		 298 aa  258  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  46.69 
 
 		 298 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  47.02 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  46.67 
 
 		 298 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  46.69 
 
 		 298 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  46.98 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  43.84 
 
 		 297 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  37.79 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  39.58 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  38.33 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  38.93 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  38 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  36.45 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  37.75 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  38.93 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  37.5 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  38.26 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  35.79 
 
 		 295 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  37.79 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  37.66 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  38.56 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  38.38 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  37.25 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  37.21 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  37.46 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  37.21 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  37.5 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  36.98 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  36.21 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  38.05 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  36.86 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  33.24 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  38.91 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  35.76 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  34.65 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  37.29 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  35.13 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  36.3 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  34.56 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  37.33 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  37.75 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  35.64 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  35.64 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  35.64 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  36.3 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  36.72 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  37.66 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  37.95 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  33.89 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  35.35 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  34.87 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  35.79 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  35.43 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  35.33 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  35.64 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  34.32 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  35.88 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  35.12 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  35.2 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  34.55 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  34.55 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  36.36 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  33 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  32.33 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  34.65 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  33.44 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  36.78 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  36.99 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  34.1 
 
 		 315 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  35.45 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  35.1 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  35.1 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  36.66 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  37.17 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  36.51 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  35.12 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  34.49 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  35.93 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  35.1 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  34.78 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  38.64 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  35.35 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  35.31 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  34.78 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  36.89 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  34.78 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  34.56 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  35.43 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  36.24 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  33.89 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>