More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1747 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 222 aa  111  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  37.08 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 261 aa  101  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 277 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 255 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.21 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  28.21 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  26.07 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  28.43 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0655  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 257 aa  90.1  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110649  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  27.64 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 265 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 284 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  27.48 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>