More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1717 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1717  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1676  gamma-glutamyl kinase  59.62 
 
 
267 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0283  gamma-glutamyl kinase  58.71 
 
 
267 aa  334  9e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0346  glutamate 5-kinase  54.09 
 
 
262 aa  285  5.999999999999999e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2904  gamma-glutamyl kinase  49.43 
 
 
269 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2583  gamma-glutamyl kinase  49.43 
 
 
269 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1766  gamma-glutamyl kinase  49.24 
 
 
277 aa  259  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000141606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2877  gamma-glutamyl kinase  47.39 
 
 
272 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.518001  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0947  glutamate 5-kinase  48.13 
 
 
268 aa  243  3e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0230243  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  47.94 
 
 
373 aa  238  5e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1645  glutamate 5-kinase  46.12 
 
 
266 aa  228  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0294  glutamate 5-kinase  49.22 
 
 
262 aa  228  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 
372 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2603  glutamate 5-kinase  44.87 
 
 
282 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  44.4 
 
 
373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  42.01 
 
 
373 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  45.42 
 
 
375 aa  214  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  42.64 
 
 
378 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
369 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
369 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  45.38 
 
 
369 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2415  gamma-glutamyl kinase  41.83 
 
 
375 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0941339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3029  gamma-glutamyl kinase  42.69 
 
 
367 aa  198  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0863421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2251  gamma-glutamyl kinase  42.69 
 
 
367 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00921401  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  43.07 
 
 
374 aa  198  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  41.63 
 
 
369 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  43.61 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  45.38 
 
 
387 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2994  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.13461  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  41.2 
 
 
393 aa  195  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2731  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
367 aa  195  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.681292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  41.44 
 
 
390 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2993  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
367 aa  194  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0371312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2989  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
414 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2782  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
386 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2712  gamma-glutamyl kinase  42.31 
 
 
386 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2790  gamma-glutamyl kinase  41.92 
 
 
367 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.558621  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  40.77 
 
 
367 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  40.78 
 
 
373 aa  193  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  41.76 
 
 
406 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  45.56 
 
 
372 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  42.08 
 
 
373 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  44.79 
 
 
372 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  41.89 
 
 
374 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7269  glutamate 5-kinase  40.6 
 
 
375 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  44.4 
 
 
372 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  41.13 
 
 
373 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  41.31 
 
 
367 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  41.51 
 
 
374 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1381  glutamate 5-kinase  39.47 
 
 
270 aa  187  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2179  gamma-glutamyl kinase  39.02 
 
 
388 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  44.02 
 
 
374 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  39.22 
 
 
373 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 
372 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 
372 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 
372 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  40.54 
 
 
369 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 
372 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  39.25 
 
 
374 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4151  glutamate 5-kinase  41.92 
 
 
376 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
369 aa  185  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  38.82 
 
 
373 aa  184  9e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  42.59 
 
 
374 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  40.52 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  38.04 
 
 
382 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  40.23 
 
 
382 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  42.47 
 
 
379 aa  182  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  41.41 
 
 
370 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2256  glutamate 5-kinase  38.58 
 
 
372 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  38.52 
 
 
376 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1551  glutamate 5-kinase  42.97 
 
 
388 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0199674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  38.95 
 
 
372 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  39 
 
 
260 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3028  gamma-glutamyl kinase  40.91 
 
 
353 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0223957  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  39.22 
 
 
377 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  40.08 
 
 
260 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  38.82 
 
 
383 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3943  gamma-glutamyl kinase  41.38 
 
 
366 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.82203  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  39.22 
 
 
370 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  39.69 
 
 
366 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  38.58 
 
 
363 aa  175  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  38.02 
 
 
381 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  39.92 
 
 
367 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  40.68 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  34.57 
 
 
377 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  38.55 
 
 
376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  38.55 
 
 
376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  37.88 
 
 
376 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  36.4 
 
 
375 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  38.4 
 
 
367 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  38.4 
 
 
367 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  38.4 
 
 
367 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  38.4 
 
 
367 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  38.4 
 
 
367 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  39.08 
 
 
367 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  38.78 
 
 
367 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  38.78 
 
 
367 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  35.32 
 
 
379 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  38.78 
 
 
367 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  38.78 
 
 
367 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>