More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1679 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1679  integrase  100 
 
 		 372 aa  759    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  32.42 
 
 		 374 aa  172  9e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  30.17 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  30.17 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  29.76 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  29.76 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 376 aa  120  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0545  prophage LambdaSa1, site-specific recombinase phage integrase family protein  28.27 
 
 		 359 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000831336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.1 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.1 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.53 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.65 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  30.06 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.6 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  27.22 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  21.71 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.41 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.93 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  26.32 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  22.05 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.42 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.5 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  23.2 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  23.02 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  27.91 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  21.33 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.22 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.67 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  22.02 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  23.98 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  19.45 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  22.04 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.43 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.69 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.25 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.29 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  25.66 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  23.62 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  20.87 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  25.4 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.97 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  26.56 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.8 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  23.93 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.63 
 
 		 386 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  23.6 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  24.73 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1417  integrase  25.2 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  22.66 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  23.05 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.97 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  21.83 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  22.67 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  21.36 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  20.22 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  21.5 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.24 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  21.99 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  27.73 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  24.79 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  30.73 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.34 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.49 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  21.27 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.68 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  25.33 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  23.04 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  25.11 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  25 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  20.34 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  27.1 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  24 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.58 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  24.24 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  30.16 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  22.55 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  22.92 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.2 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.34 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  24.65 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  23 
 
 		 506 aa  59.7  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  28.3 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  22.84 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  18.49 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.88 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.88 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.95 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  31.68 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  23.58 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  23.58 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  24.13 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.88 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.04 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>