235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1667 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  66.95 
 
 
233 aa  327  9e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  59.15 
 
 
236 aa  303  1.0000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  61.37 
 
 
233 aa  300  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  58.37 
 
 
247 aa  296  2e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  56.65 
 
 
233 aa  290  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  51.71 
 
 
234 aa  260  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  51.27 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  51.27 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  51.27 
 
 
262 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  52.12 
 
 
262 aa  250  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.85 
 
 
262 aa  248  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.85 
 
 
262 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.85 
 
 
262 aa  248  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.85 
 
 
262 aa  248  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.85 
 
 
262 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.85 
 
 
262 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.85 
 
 
262 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.62 
 
 
242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.21 
 
 
242 aa  230  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.13 
 
 
251 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.5 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.32 
 
 
243 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  47.32 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  47.32 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.21 
 
 
253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  54.46 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.28 
 
 
241 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.91 
 
 
242 aa  206  3e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.32 
 
 
240 aa  202  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  50.47 
 
 
250 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.8 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.14 
 
 
244 aa  192  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.74 
 
 
242 aa  192  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.74 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.97 
 
 
256 aa  182  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.81 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.5 
 
 
263 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.91 
 
 
268 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.08 
 
 
262 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.39 
 
 
266 aa  175  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  40.25 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.25 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.54 
 
 
647 aa  172  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.5 
 
 
268 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.67 
 
 
259 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  40.89 
 
 
642 aa  170  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.66 
 
 
261 aa  170  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  40.64 
 
 
670 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.33 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.06 
 
 
655 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.75 
 
 
303 aa  164  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  38.32 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.34 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.65 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.86 
 
 
260 aa  161  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.38 
 
 
260 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  44.19 
 
 
637 aa  160  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.75 
 
 
259 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2313  Glucosamine-6-phosphate deaminase  46.34 
 
 
253 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0207649  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2772  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.7 
 
 
246 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.43 
 
 
247 aa  157  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.67 
 
 
646 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.85 
 
 
641 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.6 
 
 
261 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.24 
 
 
639 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  40.18 
 
 
637 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.51 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.21 
 
 
279 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.34 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.23 
 
 
657 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.04 
 
 
642 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.82 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3405  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  37.12 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.08 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.15 
 
 
245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0225  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  37.91 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.535375  normal  0.600106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0774  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.22 
 
 
249 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.58 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.45 
 
 
277 aa  142  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  36.07 
 
 
358 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62706  Glucosamine-6-phosphate isomerase (Glucosamine-6-phosphate deaminase) (GNPDA) (GlcN6P deaminase)  38.6 
 
 
252 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1615  Glucosamine-6-phosphate deaminase  36.33 
 
 
240 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.68 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3264  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.47 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0086269 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2131  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  30.25 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.28 
 
 
642 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  34.02 
 
 
339 aa  131  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.2 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05361  6-phosphogluconolactonase/glucosamine-6- phosphate isomerase/deaminase  36.41 
 
 
274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.47 
 
 
266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.51 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.51 
 
 
266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.614639  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.38 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0338  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.51 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368594  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2997  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.51 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.67 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.06 
 
 
266 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.5 
 
 
276 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1114  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.51 
 
 
266 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.646109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>