More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1663 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 90 aa  186  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  91.11 
 
 		 90 aa  173  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  88.89 
 
 		 90 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  72.22 
 
 		 91 aa  142  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  67.82 
 
 		 139 aa  137  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 90 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  65.56 
 
 		 90 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  56.67 
 
 		 91 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  61.8 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  58.24 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  58.24 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  58.62 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  58.24 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 81 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  60.47 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  59.09 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  54.44 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  56.98 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  57.47 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  57.47 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1447  ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  56.82 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  56.82 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  57.47 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  57.32 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  52.87 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  54.84 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  55.42 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 81 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 81 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 81 aa  103  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  55.42 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  55.42 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  61.04 
 
 		 81 aa  103  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1405  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.321443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  55.95 
 
 		 183 aa  102  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  53.57 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  53.57 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  52.69 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  54.22 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  51.09 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 81 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  55.81 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  55.95 
 
 		 192 aa  100  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 93 aa  100  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  52.81 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4205  30S ribosomal protein S16  49.44 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.847506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  51.61 
 
 		 201 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 82 aa  99.4  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  54.88 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 191 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3276  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  52.69 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  51.14 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  52.38 
 
 		 197 aa  97.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 204 aa  97.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 185 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4075  30S ribosomal protein S16  49.41 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 195 aa  97.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>