More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1611 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1611  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
338 aa  678    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0206763  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0027  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  75.07 
 
 
340 aa  496  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0052  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  76.18 
 
 
339 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0879  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  69.16 
 
 
345 aa  395  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242927  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.66 
 
 
346 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.47 
 
 
344 aa  386  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1137  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.76 
 
 
346 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0325  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
346 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0283  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
346 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0268  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
346 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0271  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
346 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0328  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
346 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0342  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
346 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0296  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
346 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.34 
 
 
346 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0369  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.7 
 
 
346 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4978  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.02 
 
 
346 aa  364  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0275  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.36 
 
 
347 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.43 
 
 
340 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.21 
 
 
340 aa  358  7e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0656  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.93 
 
 
343 aa  355  5e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.597374  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0142  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.94 
 
 
345 aa  351  8.999999999999999e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.19 
 
 
349 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3469  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.35 
 
 
341 aa  351  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.19 
 
 
350 aa  346  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.34 
 
 
348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1131  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.54 
 
 
342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.54 
 
 
342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.98 
 
 
350 aa  337  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.42 
 
 
348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.53 
 
 
345 aa  335  5e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.73 
 
 
348 aa  335  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.84 
 
 
352 aa  335  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.79 
 
 
348 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.75 
 
 
358 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.15 
 
 
336 aa  334  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.44 
 
 
346 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.66 
 
 
354 aa  333  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.73 
 
 
350 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.19 
 
 
345 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.05 
 
 
356 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.72 
 
 
347 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.24 
 
 
345 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.76 
 
 
345 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.41 
 
 
339 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1672  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.71 
 
 
351 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103618  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.37 
 
 
363 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.8 
 
 
346 aa  330  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.66 
 
 
348 aa  329  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.19 
 
 
347 aa  328  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.2 
 
 
345 aa  328  7e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.12 
 
 
345 aa  328  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.89 
 
 
346 aa  328  9e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.29 
 
 
345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.19 
 
 
347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0399  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.96 
 
 
342 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.862659  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.18 
 
 
359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.99 
 
 
345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.19 
 
 
347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.99 
 
 
345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.94 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.99 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.99 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  53.99 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.99 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.99 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.99 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.5 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.34 
 
 
368 aa  326  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.64 
 
 
357 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.99 
 
 
345 aa  325  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.29 
 
 
345 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.48 
 
 
345 aa  325  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.48 
 
 
345 aa  325  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.35 
 
 
333 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.97 
 
 
354 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.07 
 
 
345 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.39 
 
 
345 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.39 
 
 
345 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.39 
 
 
345 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.04 
 
 
350 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.43 
 
 
345 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.43 
 
 
350 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1104  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.25 
 
 
339 aa  323  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.55 
 
 
347 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.38 
 
 
345 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.37 
 
 
345 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.43 
 
 
345 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.39 
 
 
345 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.43 
 
 
350 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.43 
 
 
345 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.61 
 
 
359 aa  323  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.61 
 
 
359 aa  323  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.91 
 
 
369 aa  322  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.4 
 
 
345 aa  322  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.39 
 
 
345 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.39 
 
 
345 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.82 
 
 
345 aa  322  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.38 
 
 
346 aa  322  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.07 
 
 
352 aa  322  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>