More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1601 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1601  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 413 aa  828    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.8 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.26 
 
 		 423 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0058  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.43 
 
 		 420 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0043  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.24 
 
 		 421 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.46 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.46 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.98 
 
 		 423 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.98 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.74 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.86 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.74 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.98 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.74 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.74 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.02 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.74 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0700  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  47.65 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  47.65 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.95 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.76 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0145  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.86 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000216858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.24 
 
 		 428 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.26 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.35 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.39 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.35 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.59 
 
 		 429 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 432 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.75 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 		 429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 		 428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 		 429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.97 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 428 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 428 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1134  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.3 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1156  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.3 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 428 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 426 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 		 426 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.39 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  45.43 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.17 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 		 426 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.88 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.59 
 
 		 431 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.65 
 
 		 423 aa  355  6.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.05 
 
 		 430 aa  355  7.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.07 
 
 		 430 aa  355  7.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 430 aa  355  8.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 425 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.57 
 
 		 428 aa  353  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.91 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 		 425 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.64 
 
 		 422 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.59 
 
 		 431 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.46 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0659  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.04 
 
 		 413 aa  352  5e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.80081  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 		 425 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 		 430 aa  352  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 		 425 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.87 
 
 		 425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 		 425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 		 430 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 		 431 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 		 425 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.52 
 
 		 422 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.67 
 
 		 419 aa  349  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>