More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1568 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1568  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  100 
 
 
128 aa  262  8.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0492  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  66.14 
 
 
134 aa  179  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000219354  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  40.16 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  39.2 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  39.2 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  39.2 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  39.2 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  39.2 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  39.2 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  39.2 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  38.4 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0263  FUR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  33.59 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  40.38 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  35.43 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  42.42 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  38.61 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  36.59 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  33.33 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1672  FUR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  32.35 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  32.35 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  32.35 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0222  ferric-uptake regulator  42 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 
170 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  35.16 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1296  FUR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4071  ferric uptake regulator, Fur family  41.58 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323892  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  31.62 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  31.62 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  32.59 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1641  FUR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0344  FUR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.470674  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0367  FUR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.596718  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
159 aa  67  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1354  peroxide stress regulator  40.82 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  30.51 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  33.61 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  32.65 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  31.86 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  33.05 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  32 
 
 
169 aa  62.8  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  29.92 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  29.85 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  31.86 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  31.25 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0928  FUR family manganese uptake regulator  31.45 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  36 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  34.95 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  29.1 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3112  ferric uptake regulator family protein  34.45 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.966736  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  29.66 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  28.24 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  30 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  27.91 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  31.54 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  32.79 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  27.82 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1820  ferric uptake regulator family protein  28.12 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  35.45 
 
 
136 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  29.46 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  39.8 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  35.42 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  28.79 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3019  ferric uptake regulator family protein  30.58 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000804743  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  36.78 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  31.06 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  28.81 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25080  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  33.33 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  27.48 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  27.87 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  28.91 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  28.8 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  28.91 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  33.61 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0246387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>