More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1532 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  61.54 
 
 		 196 aa  237  9e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  58.46 
 
 		 196 aa  228  5e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  52.28 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  51.26 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  48.72 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  51.78 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  51.78 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  51.78 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  51.27 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  51.27 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  51.27 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  51.27 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  51.78 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  50.25 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  50.76 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  46.77 
 
 		 202 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  44.62 
 
 		 196 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  43.94 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  45.96 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  45.96 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  42.93 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  43.59 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  44.28 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  43.52 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  42.56 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  44.44 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  40.7 
 
 		 201 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  37.95 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  36.04 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  37.04 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  42.01 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  40.83 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  37.7 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  38.19 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  35.38 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  35.94 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  32.98 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  36.62 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  38.51 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  34.17 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  34.63 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  37.84 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  34.01 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  34.52 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  37.5 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  35.23 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  34.34 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  38.01 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  35.09 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  35 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  35.35 
 
 		 218 aa  99  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  33.51 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  34.46 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.74 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  33.17 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.14 
 
 		 343 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.14 
 
 		 343 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  35.37 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.14 
 
 		 343 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.14 
 
 		 343 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  33.14 
 
 		 343 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.14 
 
 		 343 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.14 
 
 		 343 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  32.61 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.77 
 
 		 342 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.52 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.29 
 
 		 342 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  35.88 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.29 
 
 		 342 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.54 
 
 		 343 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  32 
 
 		 200 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.14 
 
 		 343 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.29 
 
 		 342 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.29 
 
 		 342 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.56 
 
 		 342 aa  91.7  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  33.51 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  34.76 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  33.15 
 
 		 196 aa  85.9  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3323  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.85 
 
 		 344 aa  85.9  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0613  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.87 
 
 		 348 aa  84.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  34.24 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0830  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.87 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.71 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0151  hypothetical protein  26.7 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3445  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.52 
 
 		 342 aa  81.6  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  35.15 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002588  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  31.72 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  33.09 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  31.76 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  30.9 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4494  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  28.57 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187247  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3636  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.9 
 
 		 347 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3507  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.9 
 
 		 347 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0840  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.9 
 
 		 347 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  30.34 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2296  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.46 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  30.39 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03421  16S rRNA m2G 1207 methyltransferase  29.83 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  30.77 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>