More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1415 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  100 
 
 		 258 aa  520  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  66.53 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  65.74 
 
 		 255 aa  314  8e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  52.36 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 257 aa  241  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  51.59 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  49.41 
 
 		 256 aa  235  4e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  48.43 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  48.18 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  49.02 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  49.02 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  51.59 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  52.71 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  51.19 
 
 		 257 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  52.17 
 
 		 257 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  51.39 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  51.19 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  51.39 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  43.7 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  51.53 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  39.45 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  47.32 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  40.95 
 
 		 338 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  49.27 
 
 		 255 aa  188  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  47.98 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2878  RNase HII  52.53 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  46.09 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  48.28 
 
 		 216 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  46.34 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  45.92 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  44.72 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  46.6 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 212 aa  175  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  47.64 
 
 		 207 aa  175  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 211 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  47 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  46.77 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  46.77 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 198 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  48.22 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  43.37 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  45.21 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  45.64 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  46 
 
 		 198 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  46 
 
 		 198 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  46 
 
 		 198 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  47.78 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  40.31 
 
 		 308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  45.5 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  36.9 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  47.22 
 
 		 209 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 201 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  44.72 
 
 		 204 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  39.43 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 201 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  39.02 
 
 		 272 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 213 aa  161  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 208 aa  161  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  46.43 
 
 		 198 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 198 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  45 
 
 		 213 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  42.42 
 
 		 214 aa  161  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 203 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  46.39 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 214 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 198 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  44.27 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 198 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  47.31 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 197 aa  158  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>