More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1405 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1405  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 419 aa  870    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0299  diaminopimelate decarboxylase  67.07 
 
 		 417 aa  588  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000126182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3249  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  62.83 
 
 		 421 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0302  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  61.87 
 
 		 419 aa  547  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28180  diaminopimelate decarboxylase  59.13 
 
 		 432 aa  532  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0514  Diaminopimelate decarboxylase  58.16 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4876  diaminopimelate decarboxylase  54.39 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000066198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1641  diaminopimelate decarboxylase  54.63 
 
 		 420 aa  458  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0628  diaminopimelate decarboxylase  54.63 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  52.93 
 
 		 413 aa  435  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00760  diaminopimelate decarboxylase  47.61 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2859  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.19 
 
 		 421 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000208534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1355  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.94 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.146910000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2135  diaminopimelate decarboxylase  44.33 
 
 		 418 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329469  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  31.73 
 
 		 425 aa  206  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  32.73 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  31.1 
 
 		 416 aa  196  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  31.6 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  33.17 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  29.76 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  31.2 
 
 		 430 aa  187  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  31.37 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  31.09 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  30.15 
 
 		 430 aa  179  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  30.1 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  29.6 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  29.98 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  29.53 
 
 		 441 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  27.64 
 
 		 433 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  29.25 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  28.89 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  29.3 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  30.27 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  29.43 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  31.6 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  28.78 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  30.47 
 
 		 418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  27.78 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  29.38 
 
 		 427 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  29.63 
 
 		 427 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  29.38 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  28.78 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  30.24 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  30.41 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  29.85 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  30.24 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1204  diaminopimelate decarboxylase  28.39 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.313013  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  28.42 
 
 		 859 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  27.89 
 
 		 859 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  28.88 
 
 		 868 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  28.75 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  28.14 
 
 		 878 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  28.91 
 
 		 445 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  28.88 
 
 		 868 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  30.3 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0454398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  30.05 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  30.05 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  31.91 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  29.41 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  29.06 
 
 		 401 aa  156  7e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  29.81 
 
 		 420 aa  156  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1329  diaminopimelate decarboxylase  27.93 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  28.85 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1438  diaminopimelate decarboxylase  27.93 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1510  diaminopimelate decarboxylase  27.93 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  29.57 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1303  diaminopimelate decarboxylase  27.93 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  28.61 
 
 		 864 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0790  diaminopimelate decarboxylase  28.71 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.867864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1542  diaminopimelate decarboxylase  27.68 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1302  diaminopimelate decarboxylase  27.68 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  30.47 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3284  diaminopimelate decarboxylase  28.3 
 
 		 420 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  29.8 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  28.12 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  28.77 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3486  diaminopimelate decarboxylase  28.88 
 
 		 420 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3625  diaminopimelate decarboxylase  28.47 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1473  diaminopimelate decarboxylase  27.68 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  29.52 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  27.37 
 
 		 850 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3415  diaminopimelate decarboxylase  27.56 
 
 		 444 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.0355245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2466  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 463 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.093066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3871  diaminopimelate decarboxylase  27.68 
 
 		 438 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.063243 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  28.89 
 
 		 401 aa  149  8e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1579  diaminopimelate decarboxylase  27.43 
 
 		 438 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0733  diaminopimelate decarboxylase  29.38 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2472  diaminopimelate decarboxylase  29.48 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.255967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1342  diaminopimelate decarboxylase  27.93 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.369143  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  28.36 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  27.43 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>