162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1390 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  30.74 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  25.49 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  25.49 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  30.39 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  30.39 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  30.39 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  23.75 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  25.22 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  40.32 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0711  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 527 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  32.39 
 
 		 436 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.77 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 147 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 195 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 196 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 146 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 490 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  37.88 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 197 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 145 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  35.71 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 113 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  24.4 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 114 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  34.38 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  33.8 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 135 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  25.1 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  29.33 
 
 		 488 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  32.84 
 
 		 459 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00600  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 127 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1953  normal  0.198014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  32.88 
 
 		 489 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0548  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  24.26 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000127482  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 99 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 72 aa  46.6  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 137 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 69 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 72 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 187 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  40 
 
 		 114 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  24.4 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 132 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 478 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  40.68 
 
 		 477 aa  45.4  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 371 aa  45.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.82 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 117 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 118 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 115 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 477 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  24.4 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 69 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0051  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 138 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 68 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 99 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 117 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  27.56 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  48.94 
 
 		 89 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  34.62 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  22.53 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  23.29 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  37.7 
 
 		 114 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  26.4 
 
 		 145 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 83 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  37.7 
 
 		 114 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1401  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 108 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  33.93 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 69 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 108 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  23.72 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 78 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 123 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 86 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 99 aa  43.9  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 142 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  27.63 
 
 		 149 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>