More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1387 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 171 aa  330  7.000000000000001e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  71.08 
 
 		 166 aa  231  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  70.48 
 
 		 167 aa  228  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  66.45 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  66.46 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  66.46 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  66.46 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  66.46 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  66.46 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  66.46 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  66.46 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  66.46 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  66.46 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  66.46 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  65.19 
 
 		 166 aa  201  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  64.52 
 
 		 166 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  61.96 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  59.51 
 
 		 166 aa  193  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  59.51 
 
 		 166 aa  193  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  54.49 
 
 		 170 aa  177  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  51.52 
 
 		 190 aa  173  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  53.01 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  52.8 
 
 		 178 aa  159  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  52.44 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  44 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  45.64 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  45.64 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  46.24 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  51.11 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  42.13 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  44.38 
 
 		 176 aa  134  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 183 aa  131  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  44.68 
 
 		 175 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  47.14 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  47.77 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  42 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  45.81 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  45.81 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  44.67 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  45.77 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  44.3 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  41.13 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  43.66 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  44.03 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  42.38 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  43.06 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  42.38 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  44.03 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  43.06 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  44.03 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  44.03 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  39.23 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  44.06 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  40.65 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  42.96 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  44.65 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  46.15 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  42.25 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  45.07 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  45.07 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  42.36 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  39.05 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  41.56 
 
 		 176 aa  114  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  46.21 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  46.21 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  45.07 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  45.07 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  40.27 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  45.07 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  45.07 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  39.58 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  45.07 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  45.07 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  45.07 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  40.97 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  40.26 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  40.97 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  45.07 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  40.97 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  44.06 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  40.97 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 174 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  41.56 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0412  50S ribosomal protein L10P  45.16 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  42.26 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  45 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  44.14 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  38.89 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  42.36 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>