More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1376 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
266 aa  538  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  52.67 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 
279 aa  265  5e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
268 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 
269 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  43.56 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 
270 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1368  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 
272 aa  211  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
266 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 
270 aa  208  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
265 aa  207  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  42.58 
 
 
260 aa  205  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
262 aa  205  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  45.75 
 
 
264 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  45.25 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  46.5 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  43.95 
 
 
490 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  43.45 
 
 
268 aa  199  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
286 aa  198  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 
264 aa  194  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
276 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
276 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0143  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
275 aa  194  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  43.72 
 
 
270 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  43.89 
 
 
275 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
270 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  43.35 
 
 
266 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 
288 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 
270 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 
270 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 
267 aa  190  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  44.67 
 
 
273 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  43.03 
 
 
497 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 
270 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  44.21 
 
 
266 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 
264 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  44.67 
 
 
270 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 
270 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  40.54 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.44 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
266 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  44.26 
 
 
270 aa  188  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 
497 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 
266 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
272 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  42.15 
 
 
264 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 
271 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
266 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 
266 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  41.31 
 
 
265 aa  186  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
285 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 
271 aa  185  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 
257 aa  186  5e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  37.79 
 
 
272 aa  185  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  41.02 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  40.68 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  40.93 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  40.61 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  39.84 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1271  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000051939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  39.18 
 
 
436 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  39.84 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  39.38 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  41.44 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  41.44 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 
267 aa  181  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  40.47 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
266 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  39.08 
 
 
268 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
266 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  40.86 
 
 
267 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
266 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  41.06 
 
 
264 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
266 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
323 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 
494 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
308 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
266 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 
271 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 
484 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 
285 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  42.62 
 
 
264 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 
266 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>