More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1244 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 252 aa  509  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  65.08 
 
 		 252 aa  344  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  63.1 
 
 		 252 aa  332  3e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  61.94 
 
 		 253 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  62.2 
 
 		 251 aa  313  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  60 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 		 253 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  59.2 
 
 		 251 aa  300  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  59.2 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  59.2 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  59.2 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  59.2 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  58.8 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  58.8 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  58.8 
 
 		 251 aa  298  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  58.8 
 
 		 251 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  58.8 
 
 		 251 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  59.2 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  59.2 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  56 
 
 		 253 aa  281  8.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  59.09 
 
 		 646 aa  274  9e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  55.74 
 
 		 251 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 		 250 aa  265  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  54.07 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  54.07 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  51.41 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  51.82 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 251 aa  254  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  53.31 
 
 		 251 aa  251  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  49.39 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 250 aa  245  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 248 aa  241  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  48.76 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  50.83 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 254 aa  234  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 654 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 257 aa  231  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 261 aa  228  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  47.08 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 650 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  45.97 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  45.83 
 
 		 243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  47.64 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  48.15 
 
 		 251 aa  221  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  44.72 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  43.36 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  45.97 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 655 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 687 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  48.98 
 
 		 263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0171  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 256 aa  214  7e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  45.9 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0237  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  44.9 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0239  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 269 aa  208  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000101955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>