264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1224 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
190 aa  396  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.76 
 
 
186 aa  230  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.6 
 
 
190 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.06 
 
 
191 aa  218  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  52.69 
 
 
189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.61 
 
 
190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2670  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.25 
 
 
192 aa  209  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0484172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.53 
 
 
191 aa  209  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.85 
 
 
186 aa  207  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.35 
 
 
193 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  50 
 
 
212 aa  205  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
204 aa  204  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.32 
 
 
202 aa  203  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.37 
 
 
186 aa  203  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.2 
 
 
194 aa  203  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 
202 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 
199 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.51 
 
 
189 aa  201  4e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
186 aa  201  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.18 
 
 
191 aa  200  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 
196 aa  200  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.39 
 
 
192 aa  197  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
183 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23730  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00337474  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.96 
 
 
191 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
200 aa  194  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.59 
 
 
214 aa  192  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  47.49 
 
 
190 aa  191  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.59 
 
 
198 aa  191  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.4 
 
 
210 aa  191  6e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.65 
 
 
197 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.59 
 
 
198 aa  190  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  49.45 
 
 
192 aa  189  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 
188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 
188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.09 
 
 
198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1933  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.89 
 
 
193 aa  188  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.2 
 
 
207 aa  187  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.11 
 
 
198 aa  187  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.54 
 
 
187 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 
198 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0057  methyladenine glycosylase  44.97 
 
 
196 aa  186  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.15 
 
 
200 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.37 
 
 
208 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.68 
 
 
204 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl277  DNA-3-methyladenine glycosidase  49.18 
 
 
187 aa  186  3e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000678325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.15 
 
 
200 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.54 
 
 
196 aa  185  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
187 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.09 
 
 
194 aa  184  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.75 
 
 
190 aa  184  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.21 
 
 
194 aa  184  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.93 
 
 
208 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2095  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.19 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.89 
 
 
200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.89 
 
 
198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.78 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.62 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.62 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.89 
 
 
200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  45.6 
 
 
202 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0312  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.46 
 
 
201 aa  182  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.547447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  48.62 
 
 
191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  45.05 
 
 
202 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.51 
 
 
186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.19 
 
 
198 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.11 
 
 
187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  45.05 
 
 
202 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  45.05 
 
 
202 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  45.05 
 
 
202 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.81 
 
 
195 aa  181  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0730  3-methyladenine DNA glycosylase  47.57 
 
 
184 aa  181  8.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.31 
 
 
187 aa  181  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 
200 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 
200 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 
200 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.09 
 
 
200 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.18 
 
 
194 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.51 
 
 
202 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  44.51 
 
 
202 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  44.51 
 
 
202 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
189 aa  178  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.57 
 
 
235 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
208 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.41 
 
 
196 aa  176  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 
201 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 
201 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.32 
 
 
185 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.48 
 
 
192 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.26 
 
 
223 aa  175  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.94 
 
 
217 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.33 
 
 
187 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0075  3-methyladenine DNA glycosylase  45.51 
 
 
184 aa  174  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  45.76 
 
 
189 aa  174  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.19 
 
 
189 aa  174  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.26 
 
 
232 aa  174  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.51 
 
 
194 aa  174  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  45.56 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>