237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1191 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  57.92 
 
 
208 aa  231  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  53.14 
 
 
214 aa  228  5e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  48.77 
 
 
211 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  46.34 
 
 
210 aa  192  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  47.06 
 
 
211 aa  192  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  47.55 
 
 
211 aa  191  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  47.72 
 
 
211 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  46.15 
 
 
209 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  46.57 
 
 
212 aa  188  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  47.55 
 
 
211 aa  188  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  46.08 
 
 
211 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  46.08 
 
 
211 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  46.08 
 
 
211 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  46.08 
 
 
211 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  46.08 
 
 
211 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  46.08 
 
 
211 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  46.08 
 
 
211 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  47.28 
 
 
213 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  46.56 
 
 
213 aa  172  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  43.35 
 
 
213 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  42.69 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  43.72 
 
 
221 aa  160  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  43.08 
 
 
212 aa  158  7e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  40.1 
 
 
219 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  38.95 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  38.86 
 
 
207 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  42.79 
 
 
213 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  42.79 
 
 
213 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  39.25 
 
 
212 aa  148  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  40.21 
 
 
192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  35.71 
 
 
206 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  38.82 
 
 
192 aa  134  8e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  44.21 
 
 
217 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  52.03 
 
 
233 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  44.77 
 
 
216 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  44.21 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  36.67 
 
 
215 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  41.07 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  36.7 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  39.18 
 
 
206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  34.93 
 
 
219 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  38.07 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  38.07 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  35.18 
 
 
198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  39.59 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  36.45 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  38.07 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  35.83 
 
 
204 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  39.88 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  46.43 
 
 
210 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  38.5 
 
 
214 aa  125  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  41.46 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  41.76 
 
 
218 aa  124  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  40.59 
 
 
203 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  40.37 
 
 
197 aa  122  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  35.43 
 
 
194 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  34.5 
 
 
197 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  37.3 
 
 
204 aa  121  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  44.97 
 
 
233 aa  121  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  34.2 
 
 
239 aa  121  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  37.11 
 
 
216 aa  121  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  38.71 
 
 
204 aa  121  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  37.29 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  36.46 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  34.5 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  37.99 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  36.32 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  49.61 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  40.37 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  33.5 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  36.72 
 
 
194 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  35.68 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  34.68 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  34.68 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  34.1 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  36.57 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  34.68 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  33.16 
 
 
195 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  33.16 
 
 
205 aa  118  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  33.53 
 
 
195 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  32.98 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  35.9 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  36 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  35.45 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  45.69 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0903  protein of unknown function UPF0029  42.86 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.30398 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  42.21 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  34.38 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  39.51 
 
 
232 aa  116  3e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  37.37 
 
 
242 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  34.72 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  35.26 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  32.81 
 
 
198 aa  115  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  35.43 
 
 
198 aa  115  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  33.16 
 
 
200 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  34.68 
 
 
195 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  42.71 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  30.77 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  30.54 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>