More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1073 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  58.38 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  55.67 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  55.33 
 
 		 216 aa  229  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  50.22 
 
 		 223 aa  223  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  51.53 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  47.44 
 
 		 214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  49.77 
 
 		 218 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  52.11 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  46.05 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  47.91 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  47.91 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  47.91 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  49.22 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  47.91 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  47.91 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  52.06 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  44.65 
 
 		 216 aa  201  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  46.51 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  46.05 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  51.01 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  46.05 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  48.44 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  51.27 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  49.48 
 
 		 202 aa  194  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 203 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 199 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 		 200 aa  191  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  49.22 
 
 		 202 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  43.98 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  44.09 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  46.77 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  46.11 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  43.06 
 
 		 214 aa  187  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  46.63 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  45.64 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  44.91 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  47.57 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  48.73 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  46 
 
 		 204 aa  184  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  48.74 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  43.98 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  45.23 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 227 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  47.67 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.9 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  47.42 
 
 		 211 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  44.65 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  45.89 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  46.35 
 
 		 205 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  45.85 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  45.36 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  44.93 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  42.01 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.04 
 
 		 204 aa  178  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  43.26 
 
 		 213 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 203 aa  177  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  42.13 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  43.27 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  47.62 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  43.23 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  46.35 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  45.63 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  46.46 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  49.48 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  44.16 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 		 215 aa  174  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>