37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1005 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1005  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  306  6.999999999999999e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000462083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0233  hypothetical protein  49.11 
 
 
133 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  45.86 
 
 
360 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1166  protein of unknown function DUF437  44.62 
 
 
180 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.320751  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4712  hypothetical protein  44.64 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0390  hypothetical protein  42.73 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4398  putative cytoplasmic protein  43.75 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.430337  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0343  hypothetical protein  41.82 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4596  hypothetical protein  43.75 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4433  putative cytoplasmic protein  43.75 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4520  hypothetical protein  43.75 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114394  normal  0.196028 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4523  putative cytoplasmic protein  43.75 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0385  hypothetical protein  40.91 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0928  hypothetical protein  39.32 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.349962  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1771  hypothetical protein  40.54 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1659  hypothetical protein  40.54 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2695  hypothetical protein  42.16 
 
 
136 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.432251  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2104  hypothetical protein  38.71 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35920  hypothetical protein  38.93 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1042  hypothetical protein  38.6 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1146  hypothetical protein  41.07 
 
 
151 aa  77  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.855253  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2538  hypothetical protein  46.32 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5003  asch domain superfamily  40.18 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0260  hypothetical protein  37.72 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0311  asch domain superfamily  40.18 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1735  hypothetical protein  38.26 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0492  hypothetical protein  40.66 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.727699  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000672  hypothetical protein  36.21 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.11314  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06553  hypothetical protein  34.48 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0247  hypothetical protein  44.44 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1901  hypothetical protein  35.59 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.623364  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1395  hypothetical protein  36.96 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1615  protein of unknown function DUF437  32.76 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.474283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1004  hypothetical protein  37.23 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.416279  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1114  hypothetical protein  37.23 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883166  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0088  protein of unknown function DUF437  33.33 
 
 
171 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1903  hypothetical protein  27.12 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>