More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0930 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  100 
 
 		 555 aa  1116    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  57.5 
 
 		 556 aa  632  1e-180  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  58.05 
 
 		 552 aa  628  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  44.33 
 
 		 579 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  44.15 
 
 		 583 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  44.15 
 
 		 579 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  44.33 
 
 		 579 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  44.15 
 
 		 583 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  44.33 
 
 		 579 aa  485  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  44.15 
 
 		 579 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  43.98 
 
 		 579 aa  482  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  44.15 
 
 		 579 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  44.33 
 
 		 579 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  43.71 
 
 		 559 aa  476  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  45.17 
 
 		 573 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  44.64 
 
 		 573 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  43.8 
 
 		 579 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  42.68 
 
 		 555 aa  455  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  39.61 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  40.5 
 
 		 562 aa  402  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  38.45 
 
 		 559 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  38.45 
 
 		 559 aa  385  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 566 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  39.38 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  37.55 
 
 		 558 aa  378  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  38.13 
 
 		 551 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  35.58 
 
 		 570 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  36.14 
 
 		 557 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  38.38 
 
 		 554 aa  352  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  38.34 
 
 		 565 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.84 
 
 		 554 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.04 
 
 		 558 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  37.23 
 
 		 586 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  37.04 
 
 		 565 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.21 
 
 		 577 aa  342  9e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  34.51 
 
 		 588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  37.12 
 
 		 553 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 588 aa  336  7e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  36.57 
 
 		 569 aa  334  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  35.86 
 
 		 552 aa  331  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 588 aa  329  7e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 551 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 565 aa  327  5e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  32.97 
 
 		 562 aa  326  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 565 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  35 
 
 		 586 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 580 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.37 
 
 		 601 aa  323  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 		 586 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.89 
 
 		 599 aa  322  8e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34.1 
 
 		 560 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 556 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 553 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  35.73 
 
 		 560 aa  320  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 		 574 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 552 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 559 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  34.2 
 
 		 578 aa  320  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 552 aa  320  6e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 552 aa  319  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 552 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  33.63 
 
 		 554 aa  317  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.75 
 
 		 554 aa  317  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  34.73 
 
 		 568 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  32.27 
 
 		 605 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  32.49 
 
 		 561 aa  312  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.73 
 
 		 552 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  32.37 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  32.37 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  32.37 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  32.37 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  32.35 
 
 		 574 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  35.58 
 
 		 587 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  34.1 
 
 		 575 aa  307  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 586 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  31.78 
 
 		 552 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  34.28 
 
 		 553 aa  306  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  34.28 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  34.28 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  34.28 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  34.28 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  34.1 
 
 		 554 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  31.83 
 
 		 553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 582 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 558 aa  303  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  33.51 
 
 		 553 aa  303  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 565 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  34.48 
 
 		 553 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.32 
 
 		 553 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 		 557 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>