More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0910 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  100 
 
 
367 aa  759  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  55.46 
 
 
366 aa  426  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  54.64 
 
 
367 aa  416  1e-115  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  48.63 
 
 
375 aa  361  9e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  49.19 
 
 
376 aa  341  1e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  45.33 
 
 
387 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  44.93 
 
 
384 aa  308  1e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  45.31 
 
 
389 aa  305  8e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  45.04 
 
 
389 aa  301  8e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  44.77 
 
 
389 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  44.5 
 
 
389 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  44.5 
 
 
389 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  44.5 
 
 
389 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  44.5 
 
 
389 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  44.5 
 
 
389 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  44.5 
 
 
389 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  44.5 
 
 
389 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  43.78 
 
 
389 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1941  alanine racemase  39.12 
 
 
370 aa  259  4e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0017462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  40.16 
 
 
392 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  40.32 
 
 
382 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  40.32 
 
 
382 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  40.05 
 
 
382 aa  255  8e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0162  alanine racemase  37.16 
 
 
371 aa  254  2e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  38.01 
 
 
391 aa  245  1e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  38.01 
 
 
391 aa  245  1e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  37.47 
 
 
391 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  37.03 
 
 
391 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  37.03 
 
 
391 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  37.3 
 
 
391 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  37.03 
 
 
391 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  37.3 
 
 
391 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  37.03 
 
 
391 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  36.81 
 
 
373 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  38.21 
 
 
373 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  37.84 
 
 
408 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  36.81 
 
 
373 aa  235  9e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  37.6 
 
 
398 aa  234  2e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  36.12 
 
 
373 aa  233  4e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  38.38 
 
 
364 aa  232  8e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  36.44 
 
 
389 aa  232  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.87 
 
 
373 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.96511e-08  decreased coverage  1.76162e-05 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1641  alanine racemase  35.28 
 
 
386 aa  229  5e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  35.14 
 
 
380 aa  228  9e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  37.33 
 
 
441 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  37.06 
 
 
370 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  34.84 
 
 
373 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  35.71 
 
 
391 aa  219  8e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  33.96 
 
 
390 aa  217  3e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  34.85 
 
 
379 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  35.05 
 
 
371 aa  216  6e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  36.34 
 
 
390 aa  214  2e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  35.9 
 
 
421 aa  213  3e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  35.22 
 
 
433 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  35.39 
 
 
384 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  34.32 
 
 
434 aa  209  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  34.32 
 
 
388 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  37.1 
 
 
377 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  35.48 
 
 
851 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  33.88 
 
 
364 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  36.1 
 
 
369 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  35.11 
 
 
386 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  35.11 
 
 
386 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  34.89 
 
 
389 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  35.14 
 
 
379 aa  206  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  36.1 
 
 
380 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  34.93 
 
 
384 aa  203  4e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  36.07 
 
 
390 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1028  alanine racemase  36.83 
 
 
368 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  35.25 
 
 
370 aa  201  2e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  34.85 
 
 
380 aa  200  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  35.26 
 
 
374 aa  199  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  32.8 
 
 
382 aa  199  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  35.2 
 
 
379 aa  199  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  35.47 
 
 
379 aa  198  1e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  33.6 
 
 
388 aa  197  2e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  33.51 
 
 
390 aa  197  2e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  8.45672e-07 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  33.52 
 
 
373 aa  195  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  33.16 
 
 
379 aa  190  3e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  31.1 
 
 
369 aa  190  4e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0422  alanine racemase  33.24 
 
 
373 aa  189  6e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  34.15 
 
 
376 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  32.34 
 
 
380 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  31.25 
 
 
378 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  34.95 
 
 
406 aa  185  9e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  31.96 
 
 
403 aa  183  4e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  32.87 
 
 
365 aa  183  5e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0933  alanine racemase  34.07 
 
 
342 aa  182  7e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1380  alanine racemase  34.44 
 
 
355 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000410979  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  31.12 
 
 
437 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.45338e-06 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  32.97 
 
 
811 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  30.24 
 
 
411 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  31.55 
 
 
417 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  31.61 
 
 
395 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  33.24 
 
 
375 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4025  alanine racemase  29.69 
 
 
375 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0198  alanine racemase  32.34 
 
 
324 aa  176  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  31.23 
 
 
403 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  36.04 
 
 
366 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0357  alanine racemase  33.33 
 
 
400 aa  174  1e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>