68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0889 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  40 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  37.33 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  39.57 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  36.91 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  36.62 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  31.13 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  31.03 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  32.46 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  29.06 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  28.21 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  28.21 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  31.3 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  29.06 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  27.35 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  27.35 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  29.27 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  29.27 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  26.83 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  30.91 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  25.41 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  39.39 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  25.66 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  25.56 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  28.3 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  26.61 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  25.23 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  29.59 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  23.77 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  26.05 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  25.86 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  23.53 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  23.77 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  29.63 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  24.58 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  34.78 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  39.13 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  39.13 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  36.11 
 
 		 153 aa  43.9  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  33.82 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  24.17 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  22.13 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  24.55 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  36.67 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  35.9 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>