More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0875 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 860 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 860 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 819 aa  862    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 813 aa  680    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 824 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 868 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 863 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 858 aa  947    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  65.39 
 
 		 804 aa  1134    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 823 aa  721    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 825 aa  762    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 		 802 aa  1162    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 863 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  83.25 
 
 		 833 aa  1446    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 859 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 868 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 		 802 aa  1162    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 802 aa  1163    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 801 aa  866    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 		 802 aa  1162    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 971 aa  775    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 823 aa  642    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 823 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 868 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 878 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 830 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 862 aa  701    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 954 aa  746    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 872 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 954 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 819 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 868 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 862 aa  698    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 851 aa  687    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 805 aa  862    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 884 aa  681    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 805 aa  894    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 875 aa  668    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 824 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 829 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 877 aa  648    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 		 802 aa  1162    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 805 aa  1092    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 865 aa  746    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 805 aa  1092    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 804 aa  891    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 969 aa  741    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 829 aa  760    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 949 aa  751    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 858 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 817 aa  659    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  53.26 
 
 		 879 aa  878    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 859 aa  679    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 827 aa  704    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 819 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 815 aa  666    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 906 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 872 aa  674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 906 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 856 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  62.02 
 
 		 806 aa  1083    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 904 aa  687    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 859 aa  709    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 856 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 819 aa  664    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 971 aa  775    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 817 aa  693    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 870 aa  667    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 824 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 816 aa  711    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 816 aa  721    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 860 aa  653    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 929 aa  635    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 859 aa  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 859 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 864 aa  665    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 872 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 824 aa  730    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 813 aa  676    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 873 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 829 aa  1700    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 829 aa  1069    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  64.08 
 
 		 804 aa  1108    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  65.04 
 
 		 808 aa  1144    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  83.49 
 
 		 833 aa  1452    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 843 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 824 aa  700    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 859 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 859 aa  685    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 832 aa  645    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 823 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 816 aa  837    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0478  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 894 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 864 aa  696    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 971 aa  775    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 859 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 968 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 864 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 829 aa  687    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 856 aa  646    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>