68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0687 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  100 
 
 		 357 aa  694    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  39.44 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  38.16 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  36.03 
 
 		 349 aa  232  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  36.03 
 
 		 349 aa  232  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  37.29 
 
 		 349 aa  219  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  35.65 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  35.38 
 
 		 348 aa  195  8.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  35.38 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  31.96 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  31.75 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  31.59 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  31.49 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  31.49 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  31.49 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 		 354 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  31.68 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  31.96 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  31.96 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  29.92 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 		 350 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  24.39 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  29.17 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  29.17 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  25.76 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  21.98 
 
 		 355 aa  99.4  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  22.74 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  22.62 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  20.98 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.73 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  21.54 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  22.08 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  20.98 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  21.84 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  23.29 
 
 		 802 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  31.68 
 
 		 773 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  24.32 
 
 		 399 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  20.48 
 
 		 400 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  21.76 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  18.05 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  22.49 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  28.07 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  19.57 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  19.57 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  19.23 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  19.57 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  21.96 
 
 		 386 aa  46.2  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  23.96 
 
 		 388 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  25.19 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  26.92 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  23.65 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  24 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  21.93 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  18.45 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  19.8 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  19.9 
 
 		 400 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  29.17 
 
 		 406 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  27.36 
 
 		 400 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  20.31 
 
 		 393 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>