220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0644 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  65.25 
 
 
666 aa  868    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  52.63 
 
 
665 aa  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  53.21 
 
 
657 aa  705    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  73.23 
 
 
673 aa  1014    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  100 
 
 
671 aa  1374    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  51.3 
 
 
682 aa  671    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  51.11 
 
 
760 aa  647    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  49.32 
 
 
650 aa  620  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  46.2 
 
 
677 aa  594  1e-168  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  47.18 
 
 
661 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  46.02 
 
 
646 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  43.84 
 
 
834 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  45.31 
 
 
650 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  45.69 
 
 
648 aa  568  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  46.11 
 
 
650 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  45.11 
 
 
655 aa  551  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  43.61 
 
 
655 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  44.58 
 
 
657 aa  538  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  42.55 
 
 
877 aa  523  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  39.44 
 
 
651 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1341  K+ transporter  43.29 
 
 
454 aa  351  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  36.91 
 
 
637 aa  313  7.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  40.58 
 
 
633 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  40.58 
 
 
633 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  34.3 
 
 
622 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  36.19 
 
 
633 aa  302  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  38.3 
 
 
647 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  36.61 
 
 
643 aa  300  4e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  38.51 
 
 
634 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  40.4 
 
 
636 aa  299  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  32.03 
 
 
630 aa  297  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  39.6 
 
 
631 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  34.81 
 
 
632 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  41.06 
 
 
651 aa  294  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  35.31 
 
 
651 aa  293  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  33.17 
 
 
637 aa  293  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  40.84 
 
 
651 aa  293  9e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  34.28 
 
 
632 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  38.65 
 
 
634 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  35.68 
 
 
620 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  32.11 
 
 
637 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  35.91 
 
 
647 aa  291  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  34.39 
 
 
611 aa  291  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  35.3 
 
 
620 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1190  hypothetical protein  34.28 
 
 
624 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  39.44 
 
 
629 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3762  K potassium transporter  33.79 
 
 
650 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  38.32 
 
 
637 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  37.65 
 
 
630 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  35.43 
 
 
620 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2302  hypothetical protein  40.42 
 
 
629 aa  286  8e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  33.28 
 
 
655 aa  286  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  38.81 
 
 
625 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  36.48 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  34.03 
 
 
642 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  34.83 
 
 
620 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0739  K potassium transporter  34.38 
 
 
647 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  36.71 
 
 
622 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  34.84 
 
 
629 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  34.08 
 
 
664 aa  283  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  33.62 
 
 
641 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  33.04 
 
 
622 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  33.87 
 
 
642 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  34.51 
 
 
621 aa  281  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  33.16 
 
 
628 aa  281  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1372  K potassium transporter  32.27 
 
 
649 aa  281  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.560989  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  40.04 
 
 
656 aa  281  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  34.05 
 
 
622 aa  280  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0141  K+ potassium transporter  34.56 
 
 
630 aa  280  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  36.5 
 
 
622 aa  280  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  33.93 
 
 
632 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  33.08 
 
 
628 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  35.51 
 
 
633 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  33.68 
 
 
631 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4277  K potassium transporter  35.14 
 
 
631 aa  278  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  35.14 
 
 
631 aa  278  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  35.19 
 
 
637 aa  278  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  33.79 
 
 
631 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  34.1 
 
 
639 aa  277  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  39 
 
 
628 aa  277  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  37.17 
 
 
622 aa  276  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  37.28 
 
 
661 aa  276  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  39.73 
 
 
636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  34.46 
 
 
634 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  39.51 
 
 
637 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  34.46 
 
 
634 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  34.72 
 
 
643 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  35.59 
 
 
637 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2239  K potassium transporter  34.03 
 
 
646 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  35.27 
 
 
633 aa  275  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  34.34 
 
 
680 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  31.87 
 
 
627 aa  273  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  36.06 
 
 
633 aa  273  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  34.97 
 
 
626 aa  273  7e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  32.09 
 
 
622 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  32.09 
 
 
622 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2054  hypothetical protein  35.51 
 
 
624 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  32.4 
 
 
626 aa  273  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  32.22 
 
 
624 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  32.98 
 
 
625 aa  273  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>