More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0626 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  230  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  45.19 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  35.24 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 255 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 198 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  33.65 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 491 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  38.68 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  34.69 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  39.77 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  39.77 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  31.43 
 
 		 449 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  31.13 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1362  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.270977  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2084  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2478  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.263723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1606  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011829  hitchhiker  0.00000000000215836 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  33.96 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  36.54 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0435  putative transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 		 165 aa  67  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517587  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0836  MerR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  31.73 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl251  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000105491  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  30.19 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  33.67 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  33 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2870  transcriptional regulator, MerR family  35.64 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  35.65 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1547  MerR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00910  predicted transcriptional regulator  32.69 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.975213  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  33.33 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  33.01 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  28.21 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  31.63 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  29.52 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  36.57 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  32.04 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  36.57 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>