More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0614 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  100 
 
 		 271 aa  552  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  48.08 
 
 		 277 aa  255  7e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  46.9 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  53.21 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  40.08 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  46.98 
 
 		 281 aa  185  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  45.25 
 
 		 282 aa  181  9.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  43.84 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  42.18 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  41.84 
 
 		 288 aa  175  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  36.9 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  43.95 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  43.64 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.04 
 
 		 289 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  37.4 
 
 		 285 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  42.53 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  37.8 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.4 
 
 		 283 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  40.08 
 
 		 282 aa  161  9e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  42.17 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  40.95 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  37.01 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.61 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  37.01 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.61 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  37.01 
 
 		 283 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.22 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  36.61 
 
 		 283 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  36.61 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  35.83 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  42.6 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  38.71 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  38.24 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  37.4 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  40.38 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2153  HemK family modification methylase  39.45 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2191  HemK family modification methylase  39.45 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.961515  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  37.83 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  40.68 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  39.91 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.56 
 
 		 293 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  37.8 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  37.83 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  35.68 
 
 		 304 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  38.25 
 
 		 302 aa  145  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  32.79 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  36.6 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.1 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  38.3 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.07 
 
 		 288 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  40 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.17 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1772  HemK family modification methylase  40.53 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.6 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  40.28 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  40.72 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  35.8 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  36.4 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.98 
 
 		 299 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  40.28 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1234  HemK family modification methylase  38.21 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  38.6 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  37.61 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  38.28 
 
 		 361 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  36.4 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  36.91 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.07 
 
 		 276 aa  138  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  35.78 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  38.78 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.34 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  36.94 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  36.63 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  38.16 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  36.96 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.58 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.92 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  37.5 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  38.19 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  43.06 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1157  HemK family modification methylase  37.25 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.198451  normal  0.0970281 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  36.09 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  38.4 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  39.73 
 
 		 300 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  37.22 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  36.63 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  37.89 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.66 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.12 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  37.61 
 
 		 326 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  33.58 
 
 		 283 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.96 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  35 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.05 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  35.02 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  38.81 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  32.36 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.41 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  37.97 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  38.68 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  35.68 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>