178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0613 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  100 
 
 
251 aa  523  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  41.98 
 
 
244 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  41.15 
 
 
244 aa  208  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.15 
 
 
244 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  41.15 
 
 
244 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  41.15 
 
 
244 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  43.27 
 
 
244 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.15 
 
 
244 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.15 
 
 
244 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  41.15 
 
 
244 aa  204  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  40.74 
 
 
244 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  40.74 
 
 
244 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  42.62 
 
 
261 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  40.57 
 
 
251 aa  192  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  39.92 
 
 
249 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  39.42 
 
 
253 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  40.98 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  41.22 
 
 
243 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  40.16 
 
 
257 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  38.27 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  36.63 
 
 
248 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  36.89 
 
 
240 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  35.71 
 
 
251 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  35.71 
 
 
251 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  38.84 
 
 
240 aa  164  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  38.84 
 
 
240 aa  164  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  38.84 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  38.84 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  38.84 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  38.84 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  39.26 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  38.84 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  38.84 
 
 
240 aa  161  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  32.03 
 
 
285 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  39.92 
 
 
242 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  40.32 
 
 
248 aa  159  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  39.75 
 
 
240 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  38.37 
 
 
273 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  37.3 
 
 
240 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  36.07 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  39.67 
 
 
240 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  39.67 
 
 
240 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  39.67 
 
 
240 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  39.67 
 
 
240 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  39.26 
 
 
240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  36.89 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  33.87 
 
 
253 aa  151  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  34.4 
 
 
273 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  34.43 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  30.3 
 
 
269 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  34.26 
 
 
288 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  33.06 
 
 
250 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  33.6 
 
 
273 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  32.53 
 
 
253 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  32.52 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  35.6 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  32.93 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  36.36 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  32.69 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  30.49 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  31.15 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  32.39 
 
 
238 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  29.82 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  31.62 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  35.29 
 
 
304 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  28.05 
 
 
246 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  31.75 
 
 
276 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  28.74 
 
 
299 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  28.87 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  32.41 
 
 
274 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  30.51 
 
 
238 aa  108  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  28.46 
 
 
246 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  28.95 
 
 
240 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  31.87 
 
 
273 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  28.51 
 
 
282 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  26.48 
 
 
265 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  28.92 
 
 
247 aa  96.3  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  31.63 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  26.1 
 
 
245 aa  92  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  31.52 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  22.36 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  25 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  28.57 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.63 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  29.88 
 
 
173 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.04 
 
 
170 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.81 
 
 
204 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  26.74 
 
 
169 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.15 
 
 
175 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.5 
 
 
184 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.02 
 
 
163 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  25.45 
 
 
175 aa  55.5  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  25.41 
 
 
166 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  26.83 
 
 
192 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.27 
 
 
186 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25.13 
 
 
186 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  22.75 
 
 
176 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.86 
 
 
190 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  26.16 
 
 
171 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  30.99 
 
 
182 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>