More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0610 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  726    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  77.03 
 
 		 359 aa  579  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  77.31 
 
 		 359 aa  578  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  62.25 
 
 		 362 aa  481  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  60.23 
 
 		 362 aa  463  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  60.5 
 
 		 356 aa  454  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  55.74 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  58.15 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  56.74 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  58.15 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 361 aa  391  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  53.22 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 		 363 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  50.14 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 354 aa  371  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  51.97 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 360 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  53.22 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  52.63 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  51.97 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  51.75 
 
 		 362 aa  365  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 357 aa  363  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.17 
 
 		 367 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 363 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 363 aa  360  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  358  5e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  46.5 
 
 		 370 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 356 aa  358  8e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 360 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  46.5 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 358 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 		 370 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 		 356 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 360 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 354 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1044  peptide chain release factor 1  51.45 
 
 		 364 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  353  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 		 358 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 362 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 357 aa  351  8.999999999999999e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>