13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0590 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0590  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  376  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000937464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1065  hypothetical protein  45.6 
 
 		 190 aa  156  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0834  hypothetical protein  42.27 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0800  membrane protein-like protein  34.52 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00107023  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1328  membrane protein-like protein  32.7 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1409  hypothetical protein  45.24 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.81647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1674  hypothetical protein  44.05 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.347484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08330  predicted membrane protein  37.96 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0245  hypothetical protein  26.99 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0579  hypothetical protein  34.83 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0623  hypothetical protein  41.56 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0082  membrane protein  26 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.224712  normal  0.42558 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0621  hypothetical protein  31.86 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000832306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>