More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0588 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0588  OxaA-like protein precursor  100 
 
 
320 aa  660    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000375081  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0292  OxaA-like protein precursor  48.3 
 
 
305 aa  288  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000376025  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1608  OxaA-like protein precursor  45.34 
 
 
310 aa  256  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000470187  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1223  60 kDa inner membrane insertion protein  35.94 
 
 
316 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.092902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1396  preprotein translocase subunit YidC  35.28 
 
 
327 aa  192  9e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000130434  hitchhiker  1.60248e-23 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1729  preprotein translocase subunit YidC  32.21 
 
 
307 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0758405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0914  preprotein translocase subunit YidC  33.66 
 
 
344 aa  156  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085112  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1697  hypothetical protein  35.86 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2021  hypothetical protein  31.35 
 
 
278 aa  136  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0148683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2127  60 kDa inner membrane insertion protein  37.45 
 
 
290 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000805212  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2165  60 kDa inner membrane insertion protein  37.45 
 
 
290 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.001129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  32.58 
 
 
255 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  32.58 
 
 
258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  32.94 
 
 
255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  32.94 
 
 
255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  32.94 
 
 
255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  32.94 
 
 
255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  32.94 
 
 
255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.17 
 
 
249 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  31.97 
 
 
255 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  32.55 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  32.94 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  32.16 
 
 
255 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  32.81 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  36.1 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  34.35 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  34.35 
 
 
260 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  33.91 
 
 
260 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  32.66 
 
 
260 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  34.35 
 
 
260 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  34.35 
 
 
260 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  34.35 
 
 
260 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  33.91 
 
 
260 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  33.04 
 
 
260 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  32.1 
 
 
260 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  32.61 
 
 
257 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.36 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  31.4 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.28 
 
 
526 aa  95.5  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.87 
 
 
532 aa  93.6  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.84 
 
 
517 aa  92.4  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  32.03 
 
 
254 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  30.51 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.87 
 
 
530 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  33.64 
 
 
223 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  31.77 
 
 
209 aa  86.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.57 
 
 
530 aa  85.9  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  29.05 
 
 
545 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.33 
 
 
528 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.04 
 
 
518 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.03 
 
 
567 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  29.14 
 
 
609 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  28.8 
 
 
542 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
560 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  30.55 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.71 
 
 
546 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.71 
 
 
546 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.71 
 
 
546 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  28.77 
 
 
583 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  32.11 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 
560 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 
560 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  27.63 
 
 
545 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  31.53 
 
 
544 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 
560 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 
560 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.53 
 
 
575 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.21 
 
 
597 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.64 
 
 
557 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  29.33 
 
 
543 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  27.59 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  32.02 
 
 
541 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  33.33 
 
 
536 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.66 
 
 
620 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.07 
 
 
565 aa  79.7  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  31.2 
 
 
614 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  27.78 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  31.61 
 
 
562 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.92 
 
 
609 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
548 aa  79.3  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  30.29 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  30.34 
 
 
617 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 
548 aa  79  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  32.12 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  32.02 
 
 
541 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.61 
 
 
563 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  30.25 
 
 
616 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.96 
 
 
531 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.73 
 
 
545 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  31.53 
 
 
545 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.09 
 
 
541 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  30.25 
 
 
616 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  31.53 
 
 
541 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>