More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0446 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0446  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 
286 aa  583  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1574  DNA polymerase III subunit delta'  45.1 
 
 
287 aa  247  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0527  DNA polymerase III subunit delta'  42.07 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  34.66 
 
 
337 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  34.4 
 
 
327 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  34.4 
 
 
327 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  34 
 
 
327 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  33.6 
 
 
327 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  33.6 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  34 
 
 
327 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  33.6 
 
 
327 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  34 
 
 
327 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  34 
 
 
327 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  33.6 
 
 
327 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  31.95 
 
 
326 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  34.03 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  30.08 
 
 
337 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  34.65 
 
 
330 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.89 
 
 
327 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.89 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.92 
 
 
331 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.02 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  37.07 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.84 
 
 
358 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.69 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.82 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.59 
 
 
331 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.64 
 
 
320 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.18 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.31 
 
 
323 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  38.85 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.22 
 
 
328 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  36.94 
 
 
328 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  36.88 
 
 
284 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  32.75 
 
 
304 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  38.85 
 
 
330 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  36.88 
 
 
328 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.55 
 
 
304 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  35.9 
 
 
328 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.86 
 
 
332 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  30 
 
 
383 aa  102  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.66 
 
 
460 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  38.22 
 
 
327 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2239  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.85 
 
 
327 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  35.71 
 
 
499 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.98 
 
 
326 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0374  DNA replication ATPase  32.03 
 
 
285 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.885704  hitchhiker  0.00000094265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.33 
 
 
342 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.01 
 
 
343 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.92 
 
 
321 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  35.8 
 
 
328 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.29 
 
 
339 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  37.11 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.08 
 
 
338 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  35.85 
 
 
328 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.41 
 
 
478 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  35.42 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  35.85 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.72 
 
 
363 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.14 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.26 
 
 
406 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.65 
 
 
390 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.04 
 
 
478 aa  96.3  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0294  DNA-directed DNA polymerase  27.87 
 
 
399 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.89 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.25 
 
 
363 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  29.18 
 
 
339 aa  95.5  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  35.12 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  35 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  30.47 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.18 
 
 
467 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.89 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  29.3 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.89 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.51 
 
 
406 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.21 
 
 
318 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  32.74 
 
 
418 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  29.61 
 
 
412 aa  92.8  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.77 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.29 
 
 
520 aa  92.4  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.58 
 
 
340 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  37.93 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.74 
 
 
431 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  32.95 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  33.55 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.73 
 
 
339 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  32.95 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.41 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.05 
 
 
330 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.91 
 
 
344 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.21 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  29.7 
 
 
336 aa  89.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.21 
 
 
318 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  30.73 
 
 
336 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.21 
 
 
318 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2303  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.69 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0102  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.03 
 
 
635 aa  88.2  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.21 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.11798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>