More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0438 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  56.92 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  56.92 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  39.29 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  37.23 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  40.87 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  46.67 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  38.69 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  43.81 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  41.59 
 
 		 185 aa  97.4  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  42.48 
 
 		 188 aa  97.4  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  38.6 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  43.81 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  41.05 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 167 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  34.01 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 167 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  36.92 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 169 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  41.05 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  36.23 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  40.62 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  38.66 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  33.58 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  32.12 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  43.16 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  43.16 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  35.56 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  30.2 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  35.95 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  31.67 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  30.37 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  34.06 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  41.77 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  30 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  32.11 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  30.41 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  38.95 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  29.37 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  31.96 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  30.34 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  30.5 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  33.67 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  33.67 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  37.11 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>