240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0413 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  550  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  47.64 
 
 
403 aa  189  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  49.73 
 
 
411 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  43.4 
 
 
202 aa  177  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  50.57 
 
 
416 aa  175  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1082  hypothetical protein  44.34 
 
 
200 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137626  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1749  flavoprotein  44.32 
 
 
184 aa  155  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000367939  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0090  NADPH-dependent FMN reductase  41.03 
 
 
203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000795412  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1750  flavoprotein  40.78 
 
 
180 aa  138  7.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117667  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  35.96 
 
 
186 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
188 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  34.16 
 
 
186 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  31.89 
 
 
188 aa  98.6  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  37.02 
 
 
187 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  34.16 
 
 
185 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 
188 aa  95.1  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  30.27 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  31.76 
 
 
184 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  30.27 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  31.76 
 
 
184 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  30.27 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.15 
 
 
187 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  36.05 
 
 
194 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  32.34 
 
 
193 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
203 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  35.37 
 
 
188 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  35.37 
 
 
188 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  35.37 
 
 
188 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  35.37 
 
 
188 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
179 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.14 
 
 
180 aa  89  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 
220 aa  88.6  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  28.02 
 
 
192 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  31.48 
 
 
189 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 
186 aa  86.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 
187 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
183 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
184 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  33.6 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
184 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  33.6 
 
 
190 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  29.55 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
184 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
183 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
184 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
184 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  27.68 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  29.05 
 
 
186 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  34.33 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.36 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.36 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.36 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.36 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  28.02 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  29.31 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.36 
 
 
185 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  29.76 
 
 
185 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  32.18 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  27.43 
 
 
184 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  29.07 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  30.36 
 
 
185 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  26.46 
 
 
216 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  30.36 
 
 
185 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
190 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  34.33 
 
 
190 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  28.02 
 
 
189 aa  79  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.45 
 
 
181 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 
183 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  26.92 
 
 
183 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  30.29 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  30.29 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  32.72 
 
 
189 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  27.37 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  28.07 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.5 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  27.84 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  29.82 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  33.58 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  35.2 
 
 
183 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  30.11 
 
 
183 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  26.86 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  30.68 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  26.82 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  32.16 
 
 
194 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  27.53 
 
 
183 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  29.24 
 
 
184 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  27.53 
 
 
183 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  31.65 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1202  NADPH-dependent FMN reductase  37.36 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3020  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.24182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>