More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0397 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  76.09 
 
 
299 aa  479  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  74.75 
 
 
299 aa  477  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  60.26 
 
 
301 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  59.93 
 
 
302 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  59.93 
 
 
301 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  59.6 
 
 
301 aa  391  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  59.6 
 
 
301 aa  391  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  59.6 
 
 
301 aa  391  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  59.6 
 
 
301 aa  391  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  59.93 
 
 
301 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  59.6 
 
 
301 aa  391  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  59.6 
 
 
301 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  59.6 
 
 
301 aa  391  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  59.6 
 
 
301 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  58.94 
 
 
302 aa  387  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  58.22 
 
 
303 aa  375  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  60.93 
 
 
301 aa  363  2e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  57.86 
 
 
305 aa  363  3e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  57.82 
 
 
299 aa  358  7e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  57.82 
 
 
299 aa  358  7e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  58.98 
 
 
303 aa  357  9.999999999999999e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  55.44 
 
 
299 aa  346  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  52.03 
 
 
303 aa  338  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  50.33 
 
 
302 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  50.5 
 
 
300 aa  323  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  47.81 
 
 
298 aa  316  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  50.86 
 
 
293 aa  315  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  51.18 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 
299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  47.97 
 
 
300 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  48.65 
 
 
303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  48.66 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  48.15 
 
 
297 aa  299  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 
301 aa  298  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 
308 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  49.5 
 
 
297 aa  295  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 
298 aa  294  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  46.6 
 
 
296 aa  291  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 
294 aa  291  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 
296 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  47.14 
 
 
303 aa  288  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  47.8 
 
 
311 aa  287  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  47.65 
 
 
296 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  47.62 
 
 
300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  48.65 
 
 
301 aa  282  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 
303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  48.66 
 
 
296 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  46.18 
 
 
307 aa  281  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 
302 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  47.51 
 
 
337 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  44.26 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  44.26 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  46.84 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  47.18 
 
 
301 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  46.83 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 
315 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  46.1 
 
 
314 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  46.33 
 
 
318 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 
311 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  46.1 
 
 
314 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.39 
 
 
324 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  47.1 
 
 
315 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  43.89 
 
 
319 aa  261  8.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 
343 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  42.62 
 
 
314 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  44.17 
 
 
299 aa  257  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 
293 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  44.26 
 
 
300 aa  255  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 
320 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 
320 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  42.19 
 
 
314 aa  249  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 
307 aa  249  4e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 
293 aa  249  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 
468 aa  248  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  41.3 
 
 
306 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  42.66 
 
 
307 aa  246  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  41.14 
 
 
312 aa  246  3e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 
489 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 
451 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 
301 aa  245  8e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 
300 aa  244  9e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 
449 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  42.72 
 
 
310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 
294 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  42.07 
 
 
310 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 
295 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 
310 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 
301 aa  242  7e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 
301 aa  242  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 
293 aa  241  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 
303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>