227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0354 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0354  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  100 
 
 
317 aa  646    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1454  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.54 
 
 
846 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.728613  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3578  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.35 
 
 
456 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.63 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4133  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.49 
 
 
464 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.6578  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2074  HesA/MoeB/ThiF family protein  30.08 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.316496  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1297  oligoendopeptidase F  29.02 
 
 
777 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.907343  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  30.56 
 
 
252 aa  59.7  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54676  Ubiquitin--protein ligase molybdopterin-converting factor  27.14 
 
 
437 aa  59.7  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.33 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0037  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.32 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1880  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.94 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3654  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  25.44 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.5 
 
 
244 aa  55.8  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.27 
 
 
270 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5151  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.16 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  26.4 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.63 
 
 
264 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  28.76 
 
 
200 aa  53.1  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  25.45 
 
 
260 aa  52  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.27 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.8 
 
 
443 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  29.41 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.9 
 
 
264 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.56 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.17 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.38 
 
 
604 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  29.41 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  27.27 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 
244 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.17 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19960  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  29.52 
 
 
233 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  25.93 
 
 
272 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.95 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46734  predicted protein  27.2 
 
 
438 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.05 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 
377 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.9 
 
 
390 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.19 
 
 
604 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.8 
 
 
253 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4877  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.12 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0599  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 
354 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1681  HesA/MoeB/ThiF family protein  27.06 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  25.62 
 
 
386 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2199  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.06 
 
 
268 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.05 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01046  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.97 
 
 
256 aa  50.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.54 
 
 
254 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0018  hypothetical protein  39.19 
 
 
347 aa  49.7  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0766  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.56 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0217212  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3157  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.12 
 
 
261 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.08 
 
 
387 aa  49.3  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2477  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.38 
 
 
338 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.509569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3396  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  21.68 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270344  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 
253 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.51 
 
 
604 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.65 
 
 
387 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.73 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.25 
 
 
242 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.94 
 
 
395 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69865  predicted protein  27.19 
 
 
1021 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.91244 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.68 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  28.57 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  31.94 
 
 
379 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  26.88 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.84 
 
 
399 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.88 
 
 
247 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00531734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  25.5 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33774  ubiquitin-activating enzyme E1, protein 3  23.81 
 
 
462 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.88 
 
 
199 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.82 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3943  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000910136  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1985  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.17 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.67 
 
 
598 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00160  ubiquitin-like conjugating enzyme, putative  32.53 
 
 
675 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
216 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.28 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2480  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.59 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.28 
 
 
259 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.02 
 
 
364 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.94 
 
 
390 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.84 
 
 
399 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.32 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13900  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  35.71 
 
 
550 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2472  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.56 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0008  hypothetical protein  28.7 
 
 
340 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3592  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  27.82 
 
 
338 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.17 
 
 
281 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.14 
 
 
253 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.82 
 
 
255 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34373  predicted protein  26.21 
 
 
418 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1086  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  21.62 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.29 
 
 
706 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00326971  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.11 
 
 
267 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.3 
 
 
278 aa  46.6  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0012  hypothetical protein  32.86 
 
 
340 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.650059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1642  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  35.14 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1602  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.8 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  25 
 
 
256 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>