More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0344 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  100 
 
 
427 aa  875    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  47.86 
 
 
411 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1042  Co/Zn/Cd cation transporter  48.56 
 
 
398 aa  358  8e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0463512  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  49.64 
 
 
291 aa  273  5.000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  46.21 
 
 
293 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  46.95 
 
 
296 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  46.95 
 
 
293 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  46.95 
 
 
293 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  46.95 
 
 
293 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 
292 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  46.59 
 
 
293 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  46.59 
 
 
296 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  46.59 
 
 
293 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  46.59 
 
 
296 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  46.59 
 
 
296 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 
293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  38.83 
 
 
293 aa  219  8.999999999999998e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 
288 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 
288 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2423  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
291 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
301 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  32.79 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 
306 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 
312 aa  140  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  29.41 
 
 
296 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  30.58 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  30.77 
 
 
299 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  30.24 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  30.58 
 
 
297 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  29.87 
 
 
313 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  30.24 
 
 
298 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.24 
 
 
297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.24 
 
 
298 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  30.24 
 
 
298 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  30.24 
 
 
297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  30.24 
 
 
298 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  29.1 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  28.27 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 
291 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
297 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 
300 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  31.21 
 
 
289 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  30.85 
 
 
289 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 
292 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  27.97 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  27.55 
 
 
299 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  27.21 
 
 
293 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  27.72 
 
 
291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  27.53 
 
 
299 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  26.79 
 
 
393 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 
333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  29.47 
 
 
299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  26.79 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  28.12 
 
 
299 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  27.14 
 
 
354 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  26.03 
 
 
299 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  27.25 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  26.99 
 
 
290 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  27 
 
 
389 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 
323 aa  113  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  30.89 
 
 
285 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  27.6 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.6 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 
384 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  26.73 
 
 
380 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.37 
 
 
311 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  25.59 
 
 
318 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  23.72 
 
 
392 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  29.14 
 
 
302 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 
311 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  29.57 
 
 
294 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  26.99 
 
 
317 aa  106  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  26.42 
 
 
380 aa  106  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  26.81 
 
 
404 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  26.81 
 
 
404 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  28.74 
 
 
331 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  27.57 
 
 
302 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  27.5 
 
 
385 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  27.43 
 
 
301 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  27.43 
 
 
385 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.57 
 
 
302 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 
289 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 
328 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  27.38 
 
 
409 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 
385 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  27.43 
 
 
289 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  27.02 
 
 
314 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  27.97 
 
 
318 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  28.32 
 
 
302 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  27.87 
 
 
418 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  27.7 
 
 
320 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  24.55 
 
 
395 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  27.11 
 
 
320 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 
385 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 
423 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  27.31 
 
 
294 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>